Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NEFMP07197 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NEFMP07197 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NEFMP07197 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NEFMP07197 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
NEFMP07197 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NEFMP07197 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NEFMP07197 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NEFMP07197 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NEFMP07197 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NEFMP07197 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NEFMP07197 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NEFMP07197 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NEFMP07197 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NEFMP07197 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
NEFMP07197 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
NEFMP07197 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NEFMP07197 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NEFMP07197 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NEFMP07197 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NEFMP07197 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NEFMP07197 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NEFMP07197 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
NEFMP07197 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NEFMP07197 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NEFMP07197 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NEFMP07197 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NEFMP07197 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NEFMP07197 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NEFMP07197 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NEFMP07197 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NEFMP07197 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NEFMP07197 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
NEFMP07197 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
NEFMP07197 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
NEFMP07197 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NEFMP07197 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NEFMP07197 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NEFMP07197 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NEFMP07197 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NEFMP07197 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NEFMP07197 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
NEFMP07197 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NEFMP07197 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
NEFMP07197 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NEFMP07197 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NEFMP07197 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NEFMP07197 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NEFMP07197 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NEFMP07197 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NEFMP07197 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NEFMP07197 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
NEFMP07197 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NEFMP07197 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NEFMP07197 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NEFMP07197 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NEFMP07197 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NEFMP07197 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NEFMP07197 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NEFMP07197 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
NEFMP07197 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NEFMP07197 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NEFMP07197 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NEFMP07197 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NEFMP07197 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
NEFMP07197 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NEFMP07197 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
NEFMP07197 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NEFMP07197 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
NEFMP07197 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NEFMP07197 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NEFMP07197 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NEFMP07197 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NEFMP07197 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
NEFMP07197 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NEFMP07197 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
NEFMP07197 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NEFMP07197 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NEFMP07197 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NEFMP07197 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NEFMP07197 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NEFMP07197 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NEFMP07197 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NEFMP07197 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NEFMP07197 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NEFMP07197 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NEFMP07197 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NEFMP07197 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NEFMP07197 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NEFMP07197 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NEFMP07197 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NEFMP07197 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NEFMP07197 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NEFMP07197 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
NEFMP07197 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NEFMP07197 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NEFMP07197 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NEFMP07197 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NEFMP07197 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NEFMP07197 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms