Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGAVP06756 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAVP06756 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGAVP06756 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGAVP06756 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGAVP06756 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGAVP06756 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGAVP06756 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGAVP06756 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGAVP06756 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGAVP06756 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGAVP06756 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGAVP06756 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGAVP06756 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAVP06756 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAVP06756 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGAVP06756 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGAVP06756 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGAVP06756 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGAVP06756 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGAVP06756 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGAVP06756 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGAVP06756 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGAVP06756 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGAVP06756 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGAVP06756 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGAVP06756 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGAVP06756 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGAVP06756 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGAVP06756 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGAVP06756 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGAVP06756 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGAVP06756 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGAVP06756 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGAVP06756 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGAVP06756 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGAVP06756 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGAVP06756 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGAVP06756 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGAVP06756 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGAVP06756 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
ITGAVP06756 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGAVP06756 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ITGAVP06756 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITGAVP06756 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITGAVP06756 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGAVP06756 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGAVP06756 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGAVP06756 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGAVP06756 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ITGAVP06756 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGAVP06756 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGAVP06756 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGAVP06756 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGAVP06756 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGAVP06756 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGAVP06756 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGAVP06756 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGAVP06756 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGAVP06756 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGAVP06756 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGAVP06756 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGAVP06756 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGAVP06756 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGAVP06756 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGAVP06756 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ITGAVP06756 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ITGAVP06756 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGAVP06756 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGAVP06756 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGAVP06756 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGAVP06756 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGAVP06756 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGAVP06756 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAVP06756 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAVP06756 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGAVP06756 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGAVP06756 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGAVP06756 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGAVP06756 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGAVP06756 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGAVP06756 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGAVP06756 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGAVP06756 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGAVP06756 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGAVP06756 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGAVP06756 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGAVP06756 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGAVP06756 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGAVP06756 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGAVP06756 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGAVP06756 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGAVP06756 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGAVP06756 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGAVP06756 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGAVP06756 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGAVP06756 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGAVP06756 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGAVP06756 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGAVP06756 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms