Protein–RNA interactions for Protein: P06315

IGKV5-2, Immunoglobulin kappa variable 5-2, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV5-2P06315 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
IGKV5-2P06315 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
IGKV5-2P06315 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
IGKV5-2P06315 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
IGKV5-2P06315 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
IGKV5-2P06315 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
IGKV5-2P06315 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
IGKV5-2P06315 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
IGKV5-2P06315 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
IGKV5-2P06315 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
IGKV5-2P06315 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
IGKV5-2P06315 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
IGKV5-2P06315 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
IGKV5-2P06315 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
IGKV5-2P06315 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
IGKV5-2P06315 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
IGKV5-2P06315 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
IGKV5-2P06315 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
IGKV5-2P06315 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
IGKV5-2P06315 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
IGKV5-2P06315 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
IGKV5-2P06315 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
IGKV5-2P06315 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
IGKV5-2P06315 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
IGKV5-2P06315 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
IGKV5-2P06315 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
IGKV5-2P06315 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
IGKV5-2P06315 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
IGKV5-2P06315 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
IGKV5-2P06315 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
IGKV5-2P06315 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
IGKV5-2P06315 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
IGKV5-2P06315 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
IGKV5-2P06315 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
IGKV5-2P06315 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
IGKV5-2P06315 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
IGKV5-2P06315 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
IGKV5-2P06315 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
IGKV5-2P06315 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
IGKV5-2P06315 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
IGKV5-2P06315 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
IGKV5-2P06315 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
IGKV5-2P06315 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
IGKV5-2P06315 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
IGKV5-2P06315 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
IGKV5-2P06315 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
IGKV5-2P06315 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
IGKV5-2P06315 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
IGKV5-2P06315 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
IGKV5-2P06315 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
IGKV5-2P06315 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
IGKV5-2P06315 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
IGKV5-2P06315 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
IGKV5-2P06315 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
IGKV5-2P06315 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
IGKV5-2P06315 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
IGKV5-2P06315 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
IGKV5-2P06315 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
IGKV5-2P06315 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
IGKV5-2P06315 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
IGKV5-2P06315 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
IGKV5-2P06315 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
IGKV5-2P06315 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
IGKV5-2P06315 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
IGKV5-2P06315 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
IGKV5-2P06315 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
IGKV5-2P06315 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
IGKV5-2P06315 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
IGKV5-2P06315 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
IGKV5-2P06315 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
IGKV5-2P06315 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
IGKV5-2P06315 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
IGKV5-2P06315 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
IGKV5-2P06315 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
IGKV5-2P06315 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
IGKV5-2P06315 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
IGKV5-2P06315 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
IGKV5-2P06315 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
IGKV5-2P06315 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
IGKV5-2P06315 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
IGKV5-2P06315 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
IGKV5-2P06315 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
IGKV5-2P06315 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
IGKV5-2P06315 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
IGKV5-2P06315 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
IGKV5-2P06315 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
IGKV5-2P06315 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
IGKV5-2P06315 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
IGKV5-2P06315 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
IGKV5-2P06315 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
IGKV5-2P06315 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
IGKV5-2P06315 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
IGKV5-2P06315 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
IGKV5-2P06315 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
IGKV5-2P06315 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
IGKV5-2P06315 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
IGKV5-2P06315 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
IGKV5-2P06315 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
IGKV5-2P06315 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
IGKV5-2P06315 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms