Protein–RNA interactions for Protein: P01860

IGHG3, Immunoglobulin heavy constant gamma 3, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG3P01860 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGHG3P01860 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGHG3P01860 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGHG3P01860 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGHG3P01860 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IGHG3P01860 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGHG3P01860 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGHG3P01860 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGHG3P01860 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGHG3P01860 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGHG3P01860 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IGHG3P01860 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGHG3P01860 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGHG3P01860 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGHG3P01860 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGHG3P01860 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGHG3P01860 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGHG3P01860 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGHG3P01860 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGHG3P01860 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGHG3P01860 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGHG3P01860 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGHG3P01860 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGHG3P01860 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGHG3P01860 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGHG3P01860 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGHG3P01860 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGHG3P01860 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGHG3P01860 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGHG3P01860 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGHG3P01860 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGHG3P01860 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
IGHG3P01860 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGHG3P01860 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGHG3P01860 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGHG3P01860 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGHG3P01860 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGHG3P01860 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGHG3P01860 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGHG3P01860 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGHG3P01860 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGHG3P01860 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGHG3P01860 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGHG3P01860 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGHG3P01860 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGHG3P01860 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGHG3P01860 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGHG3P01860 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGHG3P01860 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGHG3P01860 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGHG3P01860 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGHG3P01860 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGHG3P01860 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGHG3P01860 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGHG3P01860 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGHG3P01860 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGHG3P01860 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGHG3P01860 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGHG3P01860 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGHG3P01860 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGHG3P01860 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGHG3P01860 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGHG3P01860 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGHG3P01860 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IGHG3P01860 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGHG3P01860 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IGHG3P01860 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGHG3P01860 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGHG3P01860 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGHG3P01860 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGHG3P01860 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGHG3P01860 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGHG3P01860 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGHG3P01860 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGHG3P01860 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGHG3P01860 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGHG3P01860 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGHG3P01860 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGHG3P01860 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGHG3P01860 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGHG3P01860 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGHG3P01860 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGHG3P01860 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGHG3P01860 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGHG3P01860 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGHG3P01860 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGHG3P01860 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGHG3P01860 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGHG3P01860 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGHG3P01860 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGHG3P01860 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGHG3P01860 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGHG3P01860 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGHG3P01860 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGHG3P01860 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGHG3P01860 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGHG3P01860 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGHG3P01860 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGHG3P01860 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGHG3P01860 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms