Protein–RNA interactions for Protein: P01854

IGHE, Immunoglobulin heavy constant epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHEP01854 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGHEP01854 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGHEP01854 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGHEP01854 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
IGHEP01854 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGHEP01854 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGHEP01854 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
IGHEP01854 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGHEP01854 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
IGHEP01854 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IGHEP01854 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IGHEP01854 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHEP01854 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHEP01854 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHEP01854 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHEP01854 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHEP01854 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHEP01854 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHEP01854 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHEP01854 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHEP01854 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHEP01854 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHEP01854 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHEP01854 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHEP01854 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHEP01854 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGHEP01854 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGHEP01854 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGHEP01854 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGHEP01854 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IGHEP01854 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IGHEP01854 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGHEP01854 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGHEP01854 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGHEP01854 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGHEP01854 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGHEP01854 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGHEP01854 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGHEP01854 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGHEP01854 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGHEP01854 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGHEP01854 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IGHEP01854 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGHEP01854 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGHEP01854 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGHEP01854 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGHEP01854 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGHEP01854 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGHEP01854 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGHEP01854 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGHEP01854 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGHEP01854 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGHEP01854 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGHEP01854 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGHEP01854 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGHEP01854 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHEP01854 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHEP01854 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHEP01854 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHEP01854 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHEP01854 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHEP01854 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHEP01854 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGHEP01854 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGHEP01854 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGHEP01854 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGHEP01854 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHEP01854 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGHEP01854 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGHEP01854 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHEP01854 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHEP01854 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHEP01854 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHEP01854 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGHEP01854 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
IGHEP01854 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGHEP01854 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGHEP01854 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGHEP01854 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGHEP01854 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGHEP01854 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGHEP01854 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGHEP01854 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGHEP01854 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGHEP01854 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGHEP01854 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGHEP01854 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGHEP01854 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGHEP01854 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGHEP01854 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IGHEP01854 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGHEP01854 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGHEP01854 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHEP01854 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHEP01854 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHEP01854 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHEP01854 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHEP01854 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGHEP01854 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGHEP01854 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms