Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CALCAP01258 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CALCAP01258 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CALCAP01258 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CALCAP01258 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CALCAP01258 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CALCAP01258 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CALCAP01258 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CALCAP01258 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CALCAP01258 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CALCAP01258 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CALCAP01258 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CALCAP01258 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CALCAP01258 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CALCAP01258 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CALCAP01258 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CALCAP01258 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CALCAP01258 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CALCAP01258 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CALCAP01258 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CALCAP01258 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CALCAP01258 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CALCAP01258 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CALCAP01258 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CALCAP01258 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CALCAP01258 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CALCAP01258 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CALCAP01258 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CALCAP01258 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CALCAP01258 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CALCAP01258 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CALCAP01258 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CALCAP01258 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CALCAP01258 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CALCAP01258 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CALCAP01258 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CALCAP01258 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CALCAP01258 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CALCAP01258 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CALCAP01258 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CALCAP01258 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CALCAP01258 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CALCAP01258 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CALCAP01258 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CALCAP01258 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CALCAP01258 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CALCAP01258 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CALCAP01258 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CALCAP01258 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CALCAP01258 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CALCAP01258 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CALCAP01258 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CALCAP01258 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CALCAP01258 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CALCAP01258 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CALCAP01258 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CALCAP01258 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CALCAP01258 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CALCAP01258 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CALCAP01258 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CALCAP01258 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CALCAP01258 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALCAP01258 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALCAP01258 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALCAP01258 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALCAP01258 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALCAP01258 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CALCAP01258 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CALCAP01258 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CALCAP01258 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CALCAP01258 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CALCAP01258 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CALCAP01258 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CALCAP01258 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CALCAP01258 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CALCAP01258 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CALCAP01258 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CALCAP01258 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CALCAP01258 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CALCAP01258 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CALCAP01258 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CALCAP01258 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CALCAP01258 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CALCAP01258 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CALCAP01258 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CALCAP01258 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CALCAP01258 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CALCAP01258 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CALCAP01258 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CALCAP01258 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CALCAP01258 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CALCAP01258 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CALCAP01258 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CALCAP01258 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CALCAP01258 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CALCAP01258 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CALCAP01258 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CALCAP01258 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CALCAP01258 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CALCAP01258 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms