Protein–RNA interactions for Protein: P01138

NGF, Beta-nerve growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFP01138 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NGFP01138 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NGFP01138 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NGFP01138 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NGFP01138 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NGFP01138 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NGFP01138 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NGFP01138 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NGFP01138 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NGFP01138 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NGFP01138 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NGFP01138 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NGFP01138 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NGFP01138 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NGFP01138 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NGFP01138 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NGFP01138 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NGFP01138 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NGFP01138 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NGFP01138 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NGFP01138 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NGFP01138 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NGFP01138 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NGFP01138 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NGFP01138 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NGFP01138 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NGFP01138 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NGFP01138 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NGFP01138 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NGFP01138 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGFP01138 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NGFP01138 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NGFP01138 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NGFP01138 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NGFP01138 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NGFP01138 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NGFP01138 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NGFP01138 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NGFP01138 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NGFP01138 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NGFP01138 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NGFP01138 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NGFP01138 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NGFP01138 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NGFP01138 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NGFP01138 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NGFP01138 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGFP01138 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGFP01138 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGFP01138 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGFP01138 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGFP01138 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGFP01138 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NGFP01138 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NGFP01138 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NGFP01138 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NGFP01138 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NGFP01138 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NGFP01138 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NGFP01138 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NGFP01138 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NGFP01138 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGFP01138 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGFP01138 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NGFP01138 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NGFP01138 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGFP01138 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGFP01138 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NGFP01138 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NGFP01138 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NGFP01138 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NGFP01138 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NGFP01138 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NGFP01138 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NGFP01138 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NGFP01138 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NGFP01138 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NGFP01138 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NGFP01138 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NGFP01138 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NGFP01138 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NGFP01138 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NGFP01138 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NGFP01138 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NGFP01138 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NGFP01138 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NGFP01138 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NGFP01138 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NGFP01138 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NGFP01138 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NGFP01138 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NGFP01138 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NGFP01138 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NGFP01138 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NGFP01138 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NGFP01138 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NGFP01138 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NGFP01138 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NGFP01138 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NGFP01138 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms