Protein–RNA interactions for Protein: P01011

SERPINA3, Alpha-1-antichymotrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA3P01011 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERPINA3P01011 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERPINA3P01011 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SERPINA3P01011 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SERPINA3P01011 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SERPINA3P01011 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERPINA3P01011 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERPINA3P01011 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERPINA3P01011 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERPINA3P01011 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERPINA3P01011 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERPINA3P01011 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERPINA3P01011 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERPINA3P01011 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERPINA3P01011 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERPINA3P01011 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERPINA3P01011 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SERPINA3P01011 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPINA3P01011 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPINA3P01011 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPINA3P01011 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPINA3P01011 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPINA3P01011 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERPINA3P01011 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERPINA3P01011 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERPINA3P01011 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERPINA3P01011 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SERPINA3P01011 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SERPINA3P01011 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SERPINA3P01011 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SERPINA3P01011 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SERPINA3P01011 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SERPINA3P01011 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SERPINA3P01011 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SERPINA3P01011 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SERPINA3P01011 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SERPINA3P01011 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SERPINA3P01011 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SERPINA3P01011 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SERPINA3P01011 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SERPINA3P01011 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SERPINA3P01011 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SERPINA3P01011 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SERPINA3P01011 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SERPINA3P01011 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SERPINA3P01011 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SERPINA3P01011 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SERPINA3P01011 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SERPINA3P01011 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SERPINA3P01011 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SERPINA3P01011 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SERPINA3P01011 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SERPINA3P01011 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SERPINA3P01011 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SERPINA3P01011 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINA3P01011 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINA3P01011 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINA3P01011 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINA3P01011 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINA3P01011 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINA3P01011 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINA3P01011 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPINA3P01011 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPINA3P01011 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPINA3P01011 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPINA3P01011 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPINA3P01011 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPINA3P01011 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SERPINA3P01011 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SERPINA3P01011 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SERPINA3P01011 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERPINA3P01011 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERPINA3P01011 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERPINA3P01011 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SERPINA3P01011 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERPINA3P01011 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SERPINA3P01011 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SERPINA3P01011 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SERPINA3P01011 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SERPINA3P01011 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SERPINA3P01011 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERPINA3P01011 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINA3P01011 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINA3P01011 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINA3P01011 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINA3P01011 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINA3P01011 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINA3P01011 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINA3P01011 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINA3P01011 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINA3P01011 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINA3P01011 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINA3P01011 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINA3P01011 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPINA3P01011 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPINA3P01011 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINA3P01011 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINA3P01011 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINA3P01011 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINA3P01011 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms