Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SERPINA1P01009 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SERPINA1P01009 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SERPINA1P01009 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERPINA1P01009 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERPINA1P01009 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERPINA1P01009 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERPINA1P01009 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SERPINA1P01009 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SERPINA1P01009 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SERPINA1P01009 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SERPINA1P01009 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SERPINA1P01009 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SERPINA1P01009 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SERPINA1P01009 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SERPINA1P01009 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPINA1P01009 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPINA1P01009 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERPINA1P01009 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERPINA1P01009 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SERPINA1P01009 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SERPINA1P01009 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SERPINA1P01009 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SERPINA1P01009 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SERPINA1P01009 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SERPINA1P01009 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SERPINA1P01009 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SERPINA1P01009 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SERPINA1P01009 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SERPINA1P01009 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SERPINA1P01009 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SERPINA1P01009 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SERPINA1P01009 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPINA1P01009 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPINA1P01009 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPINA1P01009 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SERPINA1P01009 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINA1P01009 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINA1P01009 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINA1P01009 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERPINA1P01009 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERPINA1P01009 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINA1P01009 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SERPINA1P01009 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SERPINA1P01009 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SERPINA1P01009 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SERPINA1P01009 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SERPINA1P01009 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SERPINA1P01009 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SERPINA1P01009 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SERPINA1P01009 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SERPINA1P01009 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SERPINA1P01009 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SERPINA1P01009 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SERPINA1P01009 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SERPINA1P01009 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SERPINA1P01009 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SERPINA1P01009 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SERPINA1P01009 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SERPINA1P01009 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SERPINA1P01009 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SERPINA1P01009 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SERPINA1P01009 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SERPINA1P01009 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SERPINA1P01009 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SERPINA1P01009 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SERPINA1P01009 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SERPINA1P01009 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SERPINA1P01009 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SERPINA1P01009 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SERPINA1P01009 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SERPINA1P01009 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SERPINA1P01009 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SERPINA1P01009 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SERPINA1P01009 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SERPINA1P01009 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SERPINA1P01009 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SERPINA1P01009 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERPINA1P01009 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERPINA1P01009 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SERPINA1P01009 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SERPINA1P01009 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SERPINA1P01009 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SERPINA1P01009 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SERPINA1P01009 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SERPINA1P01009 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERPINA1P01009 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERPINA1P01009 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERPINA1P01009 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERPINA1P01009 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPINA1P01009 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPINA1P01009 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SERPINA1P01009 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SERPINA1P01009 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SERPINA1P01009 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERPINA1P01009 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERPINA1P01009 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERPINA1P01009 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERPINA1P01009 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERPINA1P01009 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms