Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
POLR1AO95602 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
POLR1AO95602 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
POLR1AO95602 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
POLR1AO95602 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
POLR1AO95602 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
POLR1AO95602 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
POLR1AO95602 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
POLR1AO95602 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
POLR1AO95602 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
POLR1AO95602 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
POLR1AO95602 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
POLR1AO95602 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
POLR1AO95602 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
POLR1AO95602 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
POLR1AO95602 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC40.17■■■■■ 4.02
POLR1AO95602 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.17■■■■■ 4.02
POLR1AO95602 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC40.16■■■■■ 4.02
POLR1AO95602 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
POLR1AO95602 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
POLR1AO95602 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
POLR1AO95602 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
POLR1AO95602 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
POLR1AO95602 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
POLR1AO95602 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
POLR1AO95602 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
POLR1AO95602 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
POLR1AO95602 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
POLR1AO95602 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
POLR1AO95602 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
POLR1AO95602 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC40.03■■■■■ 4
POLR1AO95602 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
POLR1AO95602 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
POLR1AO95602 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
POLR1AO95602 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
POLR1AO95602 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
POLR1AO95602 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
POLR1AO95602 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
POLR1AO95602 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
POLR1AO95602 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
POLR1AO95602 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
POLR1AO95602 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
POLR1AO95602 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
POLR1AO95602 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
POLR1AO95602 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
POLR1AO95602 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
POLR1AO95602 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
POLR1AO95602 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
POLR1AO95602 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
POLR1AO95602 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
POLR1AO95602 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
POLR1AO95602 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
POLR1AO95602 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
POLR1AO95602 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
POLR1AO95602 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
POLR1AO95602 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
POLR1AO95602 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC39.8■■■■□ 3.96
POLR1AO95602 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
POLR1AO95602 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
POLR1AO95602 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
POLR1AO95602 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC39.78■■■■□ 3.96
POLR1AO95602 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
POLR1AO95602 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
POLR1AO95602 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
POLR1AO95602 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
POLR1AO95602 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
POLR1AO95602 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
POLR1AO95602 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC39.74■■■■□ 3.95
POLR1AO95602 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
POLR1AO95602 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
POLR1AO95602 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
POLR1AO95602 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
POLR1AO95602 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
POLR1AO95602 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
POLR1AO95602 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
POLR1AO95602 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
POLR1AO95602 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC39.68■■■■□ 3.94
POLR1AO95602 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
POLR1AO95602 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
POLR1AO95602 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
POLR1AO95602 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
POLR1AO95602 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
POLR1AO95602 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
POLR1AO95602 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
POLR1AO95602 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
POLR1AO95602 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
POLR1AO95602 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
POLR1AO95602 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
POLR1AO95602 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
POLR1AO95602 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
POLR1AO95602 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
POLR1AO95602 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
POLR1AO95602 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
POLR1AO95602 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
POLR1AO95602 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
POLR1AO95602 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
POLR1AO95602 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
POLR1AO95602 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
POLR1AO95602 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
POLR1AO95602 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms