Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOL3O95236 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOL3O95236 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOL3O95236 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOL3O95236 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOL3O95236 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOL3O95236 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOL3O95236 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOL3O95236 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOL3O95236 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOL3O95236 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOL3O95236 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOL3O95236 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOL3O95236 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOL3O95236 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOL3O95236 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOL3O95236 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOL3O95236 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOL3O95236 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOL3O95236 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOL3O95236 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOL3O95236 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOL3O95236 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOL3O95236 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOL3O95236 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOL3O95236 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOL3O95236 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
APOL3O95236 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOL3O95236 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOL3O95236 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOL3O95236 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOL3O95236 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOL3O95236 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOL3O95236 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOL3O95236 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOL3O95236 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOL3O95236 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOL3O95236 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOL3O95236 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOL3O95236 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOL3O95236 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOL3O95236 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOL3O95236 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOL3O95236 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APOL3O95236 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOL3O95236 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOL3O95236 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOL3O95236 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOL3O95236 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOL3O95236 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOL3O95236 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOL3O95236 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOL3O95236 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOL3O95236 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
APOL3O95236 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOL3O95236 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOL3O95236 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOL3O95236 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOL3O95236 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOL3O95236 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOL3O95236 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOL3O95236 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOL3O95236 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOL3O95236 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOL3O95236 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOL3O95236 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOL3O95236 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOL3O95236 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOL3O95236 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOL3O95236 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOL3O95236 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOL3O95236 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOL3O95236 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOL3O95236 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOL3O95236 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOL3O95236 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOL3O95236 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOL3O95236 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOL3O95236 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOL3O95236 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOL3O95236 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOL3O95236 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOL3O95236 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOL3O95236 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOL3O95236 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOL3O95236 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOL3O95236 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
APOL3O95236 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOL3O95236 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOL3O95236 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOL3O95236 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOL3O95236 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
APOL3O95236 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOL3O95236 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOL3O95236 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOL3O95236 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOL3O95236 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOL3O95236 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOL3O95236 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOL3O95236 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms