Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRIG2O94898 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRIG2O94898 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRIG2O94898 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRIG2O94898 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRIG2O94898 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRIG2O94898 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRIG2O94898 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRIG2O94898 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRIG2O94898 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRIG2O94898 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LRIG2O94898 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRIG2O94898 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRIG2O94898 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRIG2O94898 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRIG2O94898 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRIG2O94898 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LRIG2O94898 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRIG2O94898 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRIG2O94898 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRIG2O94898 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRIG2O94898 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LRIG2O94898 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRIG2O94898 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRIG2O94898 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRIG2O94898 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRIG2O94898 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRIG2O94898 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRIG2O94898 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRIG2O94898 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRIG2O94898 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRIG2O94898 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRIG2O94898 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRIG2O94898 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRIG2O94898 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRIG2O94898 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRIG2O94898 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRIG2O94898 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRIG2O94898 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRIG2O94898 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRIG2O94898 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRIG2O94898 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRIG2O94898 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRIG2O94898 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRIG2O94898 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LRIG2O94898 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRIG2O94898 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRIG2O94898 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
LRIG2O94898 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRIG2O94898 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRIG2O94898 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRIG2O94898 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRIG2O94898 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRIG2O94898 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRIG2O94898 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRIG2O94898 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRIG2O94898 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LRIG2O94898 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRIG2O94898 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRIG2O94898 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRIG2O94898 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRIG2O94898 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRIG2O94898 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRIG2O94898 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRIG2O94898 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRIG2O94898 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRIG2O94898 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRIG2O94898 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRIG2O94898 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRIG2O94898 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRIG2O94898 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRIG2O94898 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRIG2O94898 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRIG2O94898 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRIG2O94898 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRIG2O94898 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRIG2O94898 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRIG2O94898 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRIG2O94898 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRIG2O94898 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRIG2O94898 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRIG2O94898 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRIG2O94898 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRIG2O94898 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRIG2O94898 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRIG2O94898 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRIG2O94898 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRIG2O94898 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRIG2O94898 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRIG2O94898 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRIG2O94898 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRIG2O94898 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRIG2O94898 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRIG2O94898 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRIG2O94898 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRIG2O94898 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRIG2O94898 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRIG2O94898 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRIG2O94898 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRIG2O94898 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms