Protein–RNA interactions for Protein: O94806

PRKD3, Serine/threonine-protein kinase D3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD3O94806 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKD3O94806 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKD3O94806 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKD3O94806 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKD3O94806 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKD3O94806 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKD3O94806 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKD3O94806 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKD3O94806 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKD3O94806 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKD3O94806 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKD3O94806 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKD3O94806 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKD3O94806 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKD3O94806 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKD3O94806 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKD3O94806 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKD3O94806 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKD3O94806 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKD3O94806 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKD3O94806 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKD3O94806 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKD3O94806 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKD3O94806 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKD3O94806 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKD3O94806 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKD3O94806 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKD3O94806 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKD3O94806 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKD3O94806 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKD3O94806 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKD3O94806 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKD3O94806 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKD3O94806 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKD3O94806 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKD3O94806 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKD3O94806 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKD3O94806 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKD3O94806 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKD3O94806 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKD3O94806 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKD3O94806 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKD3O94806 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKD3O94806 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKD3O94806 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKD3O94806 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKD3O94806 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKD3O94806 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRKD3O94806 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRKD3O94806 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKD3O94806 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKD3O94806 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKD3O94806 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKD3O94806 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKD3O94806 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKD3O94806 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKD3O94806 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKD3O94806 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKD3O94806 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKD3O94806 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKD3O94806 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKD3O94806 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKD3O94806 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKD3O94806 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKD3O94806 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKD3O94806 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKD3O94806 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKD3O94806 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKD3O94806 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKD3O94806 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKD3O94806 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKD3O94806 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKD3O94806 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKD3O94806 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKD3O94806 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKD3O94806 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKD3O94806 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKD3O94806 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKD3O94806 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKD3O94806 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKD3O94806 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKD3O94806 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKD3O94806 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKD3O94806 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKD3O94806 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKD3O94806 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKD3O94806 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKD3O94806 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKD3O94806 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKD3O94806 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKD3O94806 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKD3O94806 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRKD3O94806 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKD3O94806 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKD3O94806 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKD3O94806 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKD3O94806 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKD3O94806 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKD3O94806 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKD3O94806 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms