Protein–RNA interactions for Protein: O76038

SCGN, Secretagogin, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGNO76038 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCGNO76038 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCGNO76038 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCGNO76038 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCGNO76038 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCGNO76038 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCGNO76038 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCGNO76038 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCGNO76038 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCGNO76038 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCGNO76038 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCGNO76038 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCGNO76038 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCGNO76038 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCGNO76038 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCGNO76038 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCGNO76038 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCGNO76038 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCGNO76038 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCGNO76038 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCGNO76038 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCGNO76038 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCGNO76038 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCGNO76038 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCGNO76038 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCGNO76038 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCGNO76038 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCGNO76038 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCGNO76038 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCGNO76038 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCGNO76038 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCGNO76038 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCGNO76038 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCGNO76038 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCGNO76038 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCGNO76038 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCGNO76038 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCGNO76038 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCGNO76038 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCGNO76038 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCGNO76038 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCGNO76038 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCGNO76038 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCGNO76038 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCGNO76038 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCGNO76038 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCGNO76038 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCGNO76038 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCGNO76038 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCGNO76038 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCGNO76038 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SCGNO76038 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCGNO76038 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCGNO76038 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCGNO76038 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCGNO76038 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCGNO76038 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCGNO76038 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCGNO76038 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCGNO76038 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCGNO76038 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCGNO76038 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCGNO76038 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCGNO76038 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCGNO76038 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCGNO76038 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCGNO76038 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCGNO76038 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCGNO76038 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCGNO76038 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCGNO76038 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCGNO76038 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCGNO76038 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCGNO76038 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCGNO76038 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCGNO76038 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCGNO76038 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCGNO76038 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCGNO76038 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCGNO76038 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCGNO76038 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCGNO76038 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCGNO76038 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCGNO76038 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCGNO76038 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCGNO76038 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCGNO76038 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCGNO76038 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCGNO76038 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCGNO76038 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCGNO76038 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCGNO76038 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCGNO76038 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCGNO76038 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCGNO76038 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCGNO76038 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCGNO76038 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCGNO76038 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCGNO76038 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCGNO76038 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms