Protein–RNA interactions for Protein: O75899

GABBR2, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABBR2O75899 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GABBR2O75899 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GABBR2O75899 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GABBR2O75899 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GABBR2O75899 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GABBR2O75899 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GABBR2O75899 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GABBR2O75899 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GABBR2O75899 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GABBR2O75899 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GABBR2O75899 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GABBR2O75899 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GABBR2O75899 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GABBR2O75899 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GABBR2O75899 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GABBR2O75899 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GABBR2O75899 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GABBR2O75899 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GABBR2O75899 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GABBR2O75899 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GABBR2O75899 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GABBR2O75899 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GABBR2O75899 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GABBR2O75899 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GABBR2O75899 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GABBR2O75899 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GABBR2O75899 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GABBR2O75899 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GABBR2O75899 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GABBR2O75899 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GABBR2O75899 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GABBR2O75899 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GABBR2O75899 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GABBR2O75899 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GABBR2O75899 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GABBR2O75899 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GABBR2O75899 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GABBR2O75899 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GABBR2O75899 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GABBR2O75899 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GABBR2O75899 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GABBR2O75899 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GABBR2O75899 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GABBR2O75899 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GABBR2O75899 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GABBR2O75899 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GABBR2O75899 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GABBR2O75899 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GABBR2O75899 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GABBR2O75899 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GABBR2O75899 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GABBR2O75899 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GABBR2O75899 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GABBR2O75899 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GABBR2O75899 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GABBR2O75899 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GABBR2O75899 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GABBR2O75899 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GABBR2O75899 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GABBR2O75899 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GABBR2O75899 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GABBR2O75899 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GABBR2O75899 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GABBR2O75899 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GABBR2O75899 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GABBR2O75899 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GABBR2O75899 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GABBR2O75899 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GABBR2O75899 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GABBR2O75899 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GABBR2O75899 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GABBR2O75899 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GABBR2O75899 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GABBR2O75899 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GABBR2O75899 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GABBR2O75899 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GABBR2O75899 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GABBR2O75899 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GABBR2O75899 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GABBR2O75899 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GABBR2O75899 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GABBR2O75899 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GABBR2O75899 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GABBR2O75899 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GABBR2O75899 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GABBR2O75899 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GABBR2O75899 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GABBR2O75899 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GABBR2O75899 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GABBR2O75899 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GABBR2O75899 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GABBR2O75899 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GABBR2O75899 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GABBR2O75899 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GABBR2O75899 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GABBR2O75899 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GABBR2O75899 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GABBR2O75899 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GABBR2O75899 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GABBR2O75899 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms