Protein–RNA interactions for Protein: O75628

REM1, GTP-binding protein REM 1, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REM1O75628 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
REM1O75628 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
REM1O75628 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
REM1O75628 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
REM1O75628 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
REM1O75628 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
REM1O75628 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
REM1O75628 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
REM1O75628 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
REM1O75628 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
REM1O75628 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
REM1O75628 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
REM1O75628 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
REM1O75628 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
REM1O75628 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
REM1O75628 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
REM1O75628 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
REM1O75628 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
REM1O75628 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
REM1O75628 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
REM1O75628 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
REM1O75628 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
REM1O75628 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
REM1O75628 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
REM1O75628 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
REM1O75628 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
REM1O75628 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
REM1O75628 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
REM1O75628 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
REM1O75628 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
REM1O75628 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
REM1O75628 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
REM1O75628 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
REM1O75628 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
REM1O75628 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
REM1O75628 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
REM1O75628 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
REM1O75628 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
REM1O75628 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
REM1O75628 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
REM1O75628 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
REM1O75628 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
REM1O75628 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
REM1O75628 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
REM1O75628 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
REM1O75628 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
REM1O75628 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
REM1O75628 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
REM1O75628 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
REM1O75628 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
REM1O75628 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
REM1O75628 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
REM1O75628 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
REM1O75628 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
REM1O75628 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
REM1O75628 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
REM1O75628 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
REM1O75628 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
REM1O75628 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
REM1O75628 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
REM1O75628 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
REM1O75628 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
REM1O75628 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
REM1O75628 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
REM1O75628 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
REM1O75628 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
REM1O75628 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
REM1O75628 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
REM1O75628 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
REM1O75628 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
REM1O75628 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
REM1O75628 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
REM1O75628 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
REM1O75628 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
REM1O75628 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
REM1O75628 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
REM1O75628 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
REM1O75628 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
REM1O75628 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
REM1O75628 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
REM1O75628 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
REM1O75628 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
REM1O75628 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
REM1O75628 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REM1O75628 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
REM1O75628 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
REM1O75628 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REM1O75628 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REM1O75628 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
REM1O75628 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REM1O75628 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REM1O75628 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
REM1O75628 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
REM1O75628 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
REM1O75628 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
REM1O75628 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
REM1O75628 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
REM1O75628 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
REM1O75628 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
REM1O75628 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms