Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
E2F6O75461 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
E2F6O75461 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
E2F6O75461 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
E2F6O75461 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
E2F6O75461 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2F6O75461 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2F6O75461 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2F6O75461 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2F6O75461 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2F6O75461 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
E2F6O75461 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
E2F6O75461 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2F6O75461 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E2F6O75461 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E2F6O75461 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E2F6O75461 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
E2F6O75461 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E2F6O75461 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F6O75461 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F6O75461 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F6O75461 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F6O75461 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2F6O75461 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F6O75461 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F6O75461 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E2F6O75461 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
E2F6O75461 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E2F6O75461 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E2F6O75461 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E2F6O75461 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
E2F6O75461 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E2F6O75461 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F6O75461 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F6O75461 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F6O75461 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F6O75461 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2F6O75461 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2F6O75461 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
E2F6O75461 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
E2F6O75461 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
E2F6O75461 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
E2F6O75461 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
E2F6O75461 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
E2F6O75461 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
E2F6O75461 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2F6O75461 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
E2F6O75461 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F6O75461 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E2F6O75461 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F6O75461 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F6O75461 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F6O75461 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2F6O75461 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2F6O75461 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E2F6O75461 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E2F6O75461 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
E2F6O75461 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
E2F6O75461 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
E2F6O75461 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
E2F6O75461 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F6O75461 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F6O75461 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F6O75461 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F6O75461 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F6O75461 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F6O75461 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F6O75461 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F6O75461 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F6O75461 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
E2F6O75461 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E2F6O75461 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E2F6O75461 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
E2F6O75461 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E2F6O75461 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F6O75461 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F6O75461 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E2F6O75461 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E2F6O75461 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25■■□□□ 1.59
E2F6O75461 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E2F6O75461 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E2F6O75461 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E2F6O75461 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E2F6O75461 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E2F6O75461 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E2F6O75461 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E2F6O75461 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E2F6O75461 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
E2F6O75461 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
E2F6O75461 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
E2F6O75461 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
E2F6O75461 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
E2F6O75461 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
E2F6O75461 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
E2F6O75461 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F6O75461 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F6O75461 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F6O75461 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
E2F6O75461 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
E2F6O75461 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms