Protein–RNA interactions for Protein: O75437

ZNF254, Zinc finger protein 254, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF254O75437 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF254O75437 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF254O75437 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF254O75437 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF254O75437 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF254O75437 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF254O75437 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF254O75437 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF254O75437 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF254O75437 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF254O75437 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF254O75437 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF254O75437 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF254O75437 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF254O75437 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF254O75437 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF254O75437 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF254O75437 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF254O75437 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF254O75437 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF254O75437 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF254O75437 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF254O75437 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF254O75437 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF254O75437 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF254O75437 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF254O75437 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF254O75437 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF254O75437 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF254O75437 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF254O75437 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF254O75437 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF254O75437 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF254O75437 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF254O75437 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF254O75437 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF254O75437 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF254O75437 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF254O75437 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF254O75437 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF254O75437 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF254O75437 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF254O75437 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF254O75437 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF254O75437 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF254O75437 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF254O75437 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF254O75437 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF254O75437 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF254O75437 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF254O75437 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF254O75437 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF254O75437 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF254O75437 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF254O75437 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF254O75437 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF254O75437 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF254O75437 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF254O75437 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF254O75437 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF254O75437 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF254O75437 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF254O75437 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF254O75437 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF254O75437 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF254O75437 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF254O75437 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF254O75437 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF254O75437 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF254O75437 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF254O75437 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF254O75437 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF254O75437 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF254O75437 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF254O75437 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF254O75437 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF254O75437 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF254O75437 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF254O75437 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF254O75437 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF254O75437 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF254O75437 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF254O75437 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF254O75437 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF254O75437 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF254O75437 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF254O75437 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF254O75437 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF254O75437 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF254O75437 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF254O75437 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF254O75437 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF254O75437 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF254O75437 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF254O75437 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF254O75437 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF254O75437 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF254O75437 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF254O75437 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF254O75437 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms