Protein–RNA interactions for Protein: O75339

CILP, Cartilage intermediate layer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CILPO75339 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CILPO75339 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CILPO75339 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CILPO75339 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CILPO75339 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CILPO75339 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CILPO75339 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CILPO75339 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CILPO75339 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CILPO75339 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CILPO75339 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CILPO75339 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CILPO75339 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CILPO75339 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CILPO75339 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CILPO75339 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CILPO75339 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CILPO75339 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CILPO75339 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CILPO75339 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CILPO75339 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CILPO75339 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CILPO75339 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CILPO75339 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CILPO75339 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CILPO75339 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CILPO75339 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CILPO75339 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CILPO75339 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CILPO75339 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CILPO75339 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CILPO75339 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CILPO75339 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CILPO75339 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CILPO75339 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CILPO75339 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CILPO75339 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CILPO75339 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CILPO75339 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CILPO75339 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CILPO75339 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CILPO75339 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CILPO75339 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CILPO75339 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CILPO75339 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CILPO75339 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CILPO75339 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CILPO75339 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CILPO75339 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CILPO75339 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CILPO75339 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CILPO75339 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CILPO75339 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CILPO75339 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CILPO75339 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CILPO75339 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CILPO75339 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CILPO75339 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CILPO75339 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CILPO75339 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CILPO75339 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CILPO75339 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CILPO75339 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CILPO75339 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CILPO75339 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CILPO75339 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CILPO75339 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CILPO75339 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CILPO75339 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CILPO75339 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CILPO75339 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CILPO75339 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CILPO75339 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CILPO75339 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CILPO75339 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CILPO75339 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CILPO75339 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CILPO75339 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CILPO75339 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CILPO75339 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CILPO75339 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CILPO75339 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CILPO75339 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CILPO75339 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CILPO75339 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CILPO75339 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CILPO75339 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CILPO75339 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CILPO75339 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CILPO75339 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CILPO75339 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CILPO75339 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CILPO75339 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CILPO75339 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CILPO75339 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CILPO75339 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CILPO75339 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CILPO75339 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CILPO75339 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CILPO75339 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms