Protein–RNA interactions for Protein: O75333

TBX10, T-box transcription factor TBX10, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX10O75333 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TBX10O75333 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TBX10O75333 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TBX10O75333 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TBX10O75333 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TBX10O75333 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TBX10O75333 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TBX10O75333 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TBX10O75333 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TBX10O75333 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TBX10O75333 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TBX10O75333 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TBX10O75333 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TBX10O75333 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TBX10O75333 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TBX10O75333 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TBX10O75333 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TBX10O75333 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TBX10O75333 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TBX10O75333 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TBX10O75333 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TBX10O75333 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TBX10O75333 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TBX10O75333 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TBX10O75333 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TBX10O75333 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TBX10O75333 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TBX10O75333 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TBX10O75333 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TBX10O75333 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TBX10O75333 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TBX10O75333 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TBX10O75333 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TBX10O75333 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TBX10O75333 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TBX10O75333 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TBX10O75333 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TBX10O75333 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TBX10O75333 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TBX10O75333 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TBX10O75333 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TBX10O75333 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TBX10O75333 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TBX10O75333 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TBX10O75333 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TBX10O75333 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TBX10O75333 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TBX10O75333 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TBX10O75333 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TBX10O75333 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TBX10O75333 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TBX10O75333 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TBX10O75333 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TBX10O75333 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TBX10O75333 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TBX10O75333 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TBX10O75333 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TBX10O75333 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TBX10O75333 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TBX10O75333 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TBX10O75333 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TBX10O75333 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TBX10O75333 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TBX10O75333 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TBX10O75333 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TBX10O75333 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TBX10O75333 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TBX10O75333 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TBX10O75333 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TBX10O75333 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TBX10O75333 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TBX10O75333 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TBX10O75333 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TBX10O75333 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TBX10O75333 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TBX10O75333 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TBX10O75333 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TBX10O75333 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TBX10O75333 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TBX10O75333 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TBX10O75333 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TBX10O75333 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TBX10O75333 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TBX10O75333 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TBX10O75333 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TBX10O75333 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TBX10O75333 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TBX10O75333 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TBX10O75333 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TBX10O75333 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TBX10O75333 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TBX10O75333 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TBX10O75333 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TBX10O75333 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TBX10O75333 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TBX10O75333 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TBX10O75333 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TBX10O75333 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TBX10O75333 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TBX10O75333 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms