Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN2BO60939 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SCN2BO60939 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN2BO60939 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN2BO60939 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN2BO60939 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN2BO60939 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN2BO60939 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN2BO60939 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN2BO60939 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN2BO60939 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN2BO60939 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN2BO60939 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN2BO60939 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN2BO60939 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN2BO60939 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN2BO60939 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN2BO60939 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN2BO60939 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN2BO60939 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN2BO60939 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN2BO60939 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN2BO60939 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN2BO60939 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN2BO60939 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN2BO60939 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN2BO60939 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN2BO60939 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN2BO60939 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN2BO60939 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN2BO60939 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN2BO60939 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN2BO60939 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN2BO60939 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN2BO60939 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN2BO60939 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN2BO60939 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN2BO60939 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN2BO60939 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN2BO60939 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN2BO60939 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN2BO60939 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN2BO60939 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN2BO60939 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN2BO60939 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN2BO60939 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN2BO60939 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN2BO60939 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN2BO60939 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN2BO60939 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN2BO60939 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN2BO60939 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN2BO60939 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN2BO60939 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN2BO60939 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN2BO60939 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN2BO60939 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN2BO60939 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN2BO60939 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN2BO60939 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN2BO60939 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN2BO60939 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN2BO60939 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN2BO60939 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN2BO60939 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN2BO60939 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCN2BO60939 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN2BO60939 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN2BO60939 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN2BO60939 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN2BO60939 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN2BO60939 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN2BO60939 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN2BO60939 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN2BO60939 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN2BO60939 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN2BO60939 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN2BO60939 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN2BO60939 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN2BO60939 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN2BO60939 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN2BO60939 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN2BO60939 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN2BO60939 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN2BO60939 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN2BO60939 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN2BO60939 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN2BO60939 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN2BO60939 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN2BO60939 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN2BO60939 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN2BO60939 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN2BO60939 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN2BO60939 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN2BO60939 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN2BO60939 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN2BO60939 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN2BO60939 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN2BO60939 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN2BO60939 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms