Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNSO60931 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNSO60931 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNSO60931 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNSO60931 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNSO60931 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNSO60931 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNSO60931 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNSO60931 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNSO60931 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNSO60931 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNSO60931 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNSO60931 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNSO60931 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNSO60931 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNSO60931 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNSO60931 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNSO60931 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNSO60931 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNSO60931 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNSO60931 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNSO60931 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNSO60931 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNSO60931 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNSO60931 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNSO60931 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNSO60931 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNSO60931 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNSO60931 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNSO60931 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNSO60931 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNSO60931 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNSO60931 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNSO60931 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNSO60931 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNSO60931 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNSO60931 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNSO60931 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNSO60931 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNSO60931 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNSO60931 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNSO60931 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNSO60931 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNSO60931 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNSO60931 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNSO60931 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNSO60931 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNSO60931 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNSO60931 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNSO60931 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNSO60931 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNSO60931 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNSO60931 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNSO60931 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNSO60931 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNSO60931 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNSO60931 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNSO60931 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNSO60931 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNSO60931 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNSO60931 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNSO60931 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNSO60931 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNSO60931 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTNSO60931 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNSO60931 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNSO60931 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNSO60931 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNSO60931 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNSO60931 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNSO60931 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNSO60931 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNSO60931 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNSO60931 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNSO60931 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNSO60931 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNSO60931 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNSO60931 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNSO60931 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNSO60931 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNSO60931 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNSO60931 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNSO60931 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNSO60931 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNSO60931 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNSO60931 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNSO60931 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNSO60931 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNSO60931 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNSO60931 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNSO60931 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNSO60931 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNSO60931 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNSO60931 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNSO60931 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNSO60931 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNSO60931 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNSO60931 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNSO60931 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNSO60931 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms