Protein–RNA interactions for Protein: O60542

PSPN, Persephin, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPNO60542 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSPNO60542 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSPNO60542 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSPNO60542 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSPNO60542 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSPNO60542 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSPNO60542 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSPNO60542 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSPNO60542 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSPNO60542 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSPNO60542 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSPNO60542 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSPNO60542 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSPNO60542 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSPNO60542 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSPNO60542 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSPNO60542 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSPNO60542 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSPNO60542 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSPNO60542 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSPNO60542 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PSPNO60542 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSPNO60542 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSPNO60542 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSPNO60542 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSPNO60542 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSPNO60542 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSPNO60542 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSPNO60542 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSPNO60542 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSPNO60542 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PSPNO60542 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSPNO60542 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PSPNO60542 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSPNO60542 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSPNO60542 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSPNO60542 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPNO60542 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPNO60542 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPNO60542 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPNO60542 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSPNO60542 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSPNO60542 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSPNO60542 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSPNO60542 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSPNO60542 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSPNO60542 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSPNO60542 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSPNO60542 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSPNO60542 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSPNO60542 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSPNO60542 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSPNO60542 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSPNO60542 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSPNO60542 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSPNO60542 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSPNO60542 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSPNO60542 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSPNO60542 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSPNO60542 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSPNO60542 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSPNO60542 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSPNO60542 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSPNO60542 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSPNO60542 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSPNO60542 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSPNO60542 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSPNO60542 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSPNO60542 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSPNO60542 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSPNO60542 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSPNO60542 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSPNO60542 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPNO60542 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPNO60542 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPNO60542 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPNO60542 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPNO60542 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPNO60542 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPNO60542 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSPNO60542 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSPNO60542 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSPNO60542 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSPNO60542 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPNO60542 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSPNO60542 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSPNO60542 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSPNO60542 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSPNO60542 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSPNO60542 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSPNO60542 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSPNO60542 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSPNO60542 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSPNO60542 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSPNO60542 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSPNO60542 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSPNO60542 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPNO60542 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPNO60542 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPNO60542 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms