Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA5O60264 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA5O60264 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA5O60264 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA5O60264 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA5O60264 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA5O60264 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA5O60264 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SMARCA5O60264 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
SMARCA5O60264 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SMARCA5O60264 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SMARCA5O60264 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCA5O60264 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA5O60264 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SMARCA5O60264 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SMARCA5O60264 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SMARCA5O60264 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SMARCA5O60264 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMARCA5O60264 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMARCA5O60264 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMARCA5O60264 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SMARCA5O60264 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SMARCA5O60264 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SMARCA5O60264 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA5O60264 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SMARCA5O60264 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA5O60264 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA5O60264 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA5O60264 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SMARCA5O60264 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SMARCA5O60264 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SMARCA5O60264 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SMARCA5O60264 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SMARCA5O60264 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SMARCA5O60264 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA5O60264 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SMARCA5O60264 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SMARCA5O60264 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA5O60264 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA5O60264 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA5O60264 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SMARCA5O60264 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA5O60264 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SMARCA5O60264 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SMARCA5O60264 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SMARCA5O60264 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA5O60264 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA5O60264 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA5O60264 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA5O60264 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SMARCA5O60264 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
SMARCA5O60264 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA5O60264 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA5O60264 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA5O60264 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA5O60264 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA5O60264 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SMARCA5O60264 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SMARCA5O60264 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA5O60264 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA5O60264 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA5O60264 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SMARCA5O60264 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA5O60264 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA5O60264 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA5O60264 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA5O60264 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA5O60264 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA5O60264 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA5O60264 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA5O60264 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA5O60264 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA5O60264 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA5O60264 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA5O60264 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SMARCA5O60264 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA5O60264 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA5O60264 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA5O60264 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMARCA5O60264 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMARCA5O60264 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCA5O60264 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCA5O60264 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMARCA5O60264 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMARCA5O60264 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMARCA5O60264 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCA5O60264 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCA5O60264 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCA5O60264 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCA5O60264 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCA5O60264 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCA5O60264 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA5O60264 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA5O60264 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA5O60264 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA5O60264 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA5O60264 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA5O60264 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA5O60264 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA5O60264 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms