Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX5O60225 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX5O60225 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX5O60225 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSX5O60225 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSX5O60225 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSX5O60225 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSX5O60225 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX5O60225 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX5O60225 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX5O60225 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX5O60225 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX5O60225 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSX5O60225 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSX5O60225 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX5O60225 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSX5O60225 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSX5O60225 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSX5O60225 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX5O60225 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX5O60225 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX5O60225 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX5O60225 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX5O60225 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX5O60225 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX5O60225 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX5O60225 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX5O60225 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX5O60225 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX5O60225 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX5O60225 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX5O60225 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX5O60225 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX5O60225 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX5O60225 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX5O60225 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX5O60225 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX5O60225 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX5O60225 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX5O60225 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSX5O60225 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSX5O60225 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSX5O60225 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSX5O60225 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSX5O60225 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX5O60225 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX5O60225 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX5O60225 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX5O60225 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX5O60225 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX5O60225 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX5O60225 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX5O60225 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX5O60225 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX5O60225 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX5O60225 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX5O60225 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX5O60225 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX5O60225 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX5O60225 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX5O60225 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSX5O60225 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSX5O60225 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSX5O60225 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSX5O60225 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SSX5O60225 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX5O60225 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX5O60225 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX5O60225 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX5O60225 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX5O60225 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX5O60225 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX5O60225 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX5O60225 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX5O60225 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX5O60225 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX5O60225 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX5O60225 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX5O60225 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX5O60225 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX5O60225 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX5O60225 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX5O60225 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX5O60225 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX5O60225 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX5O60225 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX5O60225 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX5O60225 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX5O60225 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX5O60225 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SSX5O60225 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSX5O60225 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSX5O60225 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX5O60225 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX5O60225 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX5O60225 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX5O60225 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX5O60225 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX5O60225 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX5O60225 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms