Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC28A2O43868 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC28A2O43868 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC28A2O43868 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC28A2O43868 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC28A2O43868 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC28A2O43868 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC28A2O43868 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC28A2O43868 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC28A2O43868 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC28A2O43868 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC28A2O43868 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC28A2O43868 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC28A2O43868 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC28A2O43868 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC28A2O43868 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC28A2O43868 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC28A2O43868 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC28A2O43868 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC28A2O43868 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC28A2O43868 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC28A2O43868 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC28A2O43868 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC28A2O43868 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC28A2O43868 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC28A2O43868 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC28A2O43868 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC28A2O43868 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC28A2O43868 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC28A2O43868 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC28A2O43868 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC28A2O43868 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC28A2O43868 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC28A2O43868 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC28A2O43868 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC28A2O43868 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC28A2O43868 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC28A2O43868 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC28A2O43868 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC28A2O43868 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC28A2O43868 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC28A2O43868 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC28A2O43868 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC28A2O43868 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC28A2O43868 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC28A2O43868 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC28A2O43868 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC28A2O43868 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC28A2O43868 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC28A2O43868 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC28A2O43868 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC28A2O43868 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC28A2O43868 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC28A2O43868 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC28A2O43868 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC28A2O43868 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC28A2O43868 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC28A2O43868 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC28A2O43868 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC28A2O43868 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC28A2O43868 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC28A2O43868 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC28A2O43868 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC28A2O43868 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC28A2O43868 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC28A2O43868 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC28A2O43868 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC28A2O43868 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC28A2O43868 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC28A2O43868 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC28A2O43868 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC28A2O43868 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC28A2O43868 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC28A2O43868 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC28A2O43868 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC28A2O43868 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC28A2O43868 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC28A2O43868 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC28A2O43868 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC28A2O43868 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC28A2O43868 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC28A2O43868 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC28A2O43868 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC28A2O43868 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC28A2O43868 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC28A2O43868 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC28A2O43868 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC28A2O43868 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC28A2O43868 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC28A2O43868 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC28A2O43868 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC28A2O43868 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC28A2O43868 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC28A2O43868 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC28A2O43868 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC28A2O43868 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC28A2O43868 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC28A2O43868 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC28A2O43868 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC28A2O43868 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms