Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNFSF14O43557 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFSF14O43557 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFSF14O43557 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFSF14O43557 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFSF14O43557 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFSF14O43557 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFSF14O43557 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFSF14O43557 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFSF14O43557 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFSF14O43557 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFSF14O43557 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFSF14O43557 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFSF14O43557 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFSF14O43557 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFSF14O43557 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFSF14O43557 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFSF14O43557 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFSF14O43557 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNFSF14O43557 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNFSF14O43557 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFSF14O43557 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFSF14O43557 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFSF14O43557 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFSF14O43557 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFSF14O43557 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFSF14O43557 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFSF14O43557 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFSF14O43557 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFSF14O43557 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFSF14O43557 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFSF14O43557 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFSF14O43557 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFSF14O43557 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFSF14O43557 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFSF14O43557 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFSF14O43557 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFSF14O43557 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFSF14O43557 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFSF14O43557 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFSF14O43557 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFSF14O43557 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFSF14O43557 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFSF14O43557 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFSF14O43557 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFSF14O43557 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFSF14O43557 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFSF14O43557 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFSF14O43557 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFSF14O43557 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFSF14O43557 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFSF14O43557 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFSF14O43557 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFSF14O43557 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFSF14O43557 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFSF14O43557 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFSF14O43557 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFSF14O43557 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFSF14O43557 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFSF14O43557 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFSF14O43557 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFSF14O43557 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFSF14O43557 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFSF14O43557 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFSF14O43557 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFSF14O43557 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFSF14O43557 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFSF14O43557 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFSF14O43557 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFSF14O43557 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFSF14O43557 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFSF14O43557 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFSF14O43557 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFSF14O43557 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFSF14O43557 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFSF14O43557 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFSF14O43557 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFSF14O43557 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFSF14O43557 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFSF14O43557 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFSF14O43557 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFSF14O43557 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFSF14O43557 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNFSF14O43557 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNFSF14O43557 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFSF14O43557 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFSF14O43557 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFSF14O43557 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFSF14O43557 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFSF14O43557 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFSF14O43557 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFSF14O43557 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFSF14O43557 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFSF14O43557 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFSF14O43557 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFSF14O43557 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFSF14O43557 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFSF14O43557 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFSF14O43557 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFSF14O43557 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms