Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
SYNJ1O43426 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
SYNJ1O43426 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.65■■■■■ 5.06
SYNJ1O43426 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
SYNJ1O43426 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
SYNJ1O43426 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC46.6■■■■■ 5.05
SYNJ1O43426 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
SYNJ1O43426 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC46.59■■■■■ 5.05
SYNJ1O43426 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.59■■■■■ 5.05
SYNJ1O43426 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.59■■■■■ 5.05
SYNJ1O43426 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC46.57■■■■■ 5.05
SYNJ1O43426 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
SYNJ1O43426 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
SYNJ1O43426 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC46.56■■■■■ 5.04
SYNJ1O43426 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC46.56■■■■■ 5.04
SYNJ1O43426 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
SYNJ1O43426 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC46.5■■■■■ 5.03
SYNJ1O43426 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
SYNJ1O43426 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
SYNJ1O43426 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
SYNJ1O43426 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.03
SYNJ1O43426 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
SYNJ1O43426 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
SYNJ1O43426 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
SYNJ1O43426 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
SYNJ1O43426 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
SYNJ1O43426 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
SYNJ1O43426 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
SYNJ1O43426 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
SYNJ1O43426 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC46.38■■■■■ 5.01
SYNJ1O43426 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
SYNJ1O43426 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC46.36■■■■■ 5.01
SYNJ1O43426 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC46.35■■■■■ 5.01
SYNJ1O43426 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC46.35■■■■■ 5.01
SYNJ1O43426 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC46.35■■■■■ 5.01
SYNJ1O43426 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC46.34■■■■■ 5.01
SYNJ1O43426 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC46.34■■■■■ 5.01
SYNJ1O43426 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
SYNJ1O43426 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
SYNJ1O43426 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC46.28■■■■■ 5
SYNJ1O43426 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC46.26■■■■■ 5
SYNJ1O43426 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
SYNJ1O43426 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
SYNJ1O43426 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.25■■■■■ 4.99
SYNJ1O43426 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
SYNJ1O43426 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC46.25■■■■■ 4.99
SYNJ1O43426 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
SYNJ1O43426 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
SYNJ1O43426 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC46.23■■■■■ 4.99
SYNJ1O43426 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC46.22■■■■■ 4.99
SYNJ1O43426 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
SYNJ1O43426 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC46.21■■■■■ 4.99
SYNJ1O43426 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC46.2■■■■■ 4.99
SYNJ1O43426 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC46.18■■■■■ 4.98
SYNJ1O43426 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
SYNJ1O43426 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
SYNJ1O43426 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC46.16■■■■■ 4.98
SYNJ1O43426 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.15■■■■■ 4.98
SYNJ1O43426 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC46.15■■■■■ 4.98
SYNJ1O43426 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC46.15■■■■■ 4.98
SYNJ1O43426 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC46.12■■■■■ 4.97
SYNJ1O43426 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
SYNJ1O43426 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
SYNJ1O43426 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC46.09■■■■■ 4.97
SYNJ1O43426 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
SYNJ1O43426 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
SYNJ1O43426 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
SYNJ1O43426 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
SYNJ1O43426 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
SYNJ1O43426 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
SYNJ1O43426 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.05■■■■■ 4.96
SYNJ1O43426 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
SYNJ1O43426 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC46.05■■■■■ 4.96
SYNJ1O43426 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.05■■■■■ 4.96
SYNJ1O43426 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
SYNJ1O43426 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC46.04■■■■■ 4.96
SYNJ1O43426 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
SYNJ1O43426 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
SYNJ1O43426 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.01■■■■■ 4.96
SYNJ1O43426 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
SYNJ1O43426 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
SYNJ1O43426 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC45.95■■■■■ 4.95
SYNJ1O43426 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC45.94■■■■■ 4.94
SYNJ1O43426 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC45.92■■■■■ 4.94
SYNJ1O43426 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
SYNJ1O43426 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
SYNJ1O43426 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.9■■■■■ 4.94
SYNJ1O43426 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
SYNJ1O43426 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
SYNJ1O43426 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC45.87■■■■■ 4.93
SYNJ1O43426 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
SYNJ1O43426 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC45.87■■■■■ 4.93
SYNJ1O43426 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
SYNJ1O43426 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC45.84■■■■■ 4.93
SYNJ1O43426 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
SYNJ1O43426 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.83■■■■■ 4.93
SYNJ1O43426 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
SYNJ1O43426 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.92
SYNJ1O43426 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC45.81■■■■■ 4.92
SYNJ1O43426 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms