Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COCHO43405 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COCHO43405 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COCHO43405 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COCHO43405 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COCHO43405 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COCHO43405 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COCHO43405 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COCHO43405 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COCHO43405 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COCHO43405 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
COCHO43405 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COCHO43405 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COCHO43405 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COCHO43405 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COCHO43405 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COCHO43405 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COCHO43405 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
COCHO43405 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COCHO43405 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COCHO43405 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COCHO43405 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
COCHO43405 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COCHO43405 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COCHO43405 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
COCHO43405 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COCHO43405 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
COCHO43405 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COCHO43405 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COCHO43405 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COCHO43405 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COCHO43405 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
COCHO43405 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COCHO43405 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COCHO43405 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COCHO43405 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COCHO43405 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COCHO43405 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
COCHO43405 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COCHO43405 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
COCHO43405 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COCHO43405 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COCHO43405 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COCHO43405 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COCHO43405 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COCHO43405 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COCHO43405 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COCHO43405 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
COCHO43405 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COCHO43405 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COCHO43405 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COCHO43405 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COCHO43405 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COCHO43405 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COCHO43405 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COCHO43405 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COCHO43405 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COCHO43405 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COCHO43405 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COCHO43405 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COCHO43405 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COCHO43405 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COCHO43405 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COCHO43405 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COCHO43405 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COCHO43405 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COCHO43405 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COCHO43405 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COCHO43405 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
COCHO43405 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COCHO43405 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COCHO43405 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COCHO43405 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COCHO43405 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COCHO43405 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COCHO43405 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COCHO43405 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COCHO43405 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
COCHO43405 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
COCHO43405 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
COCHO43405 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COCHO43405 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COCHO43405 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COCHO43405 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COCHO43405 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COCHO43405 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COCHO43405 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COCHO43405 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COCHO43405 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COCHO43405 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COCHO43405 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COCHO43405 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COCHO43405 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COCHO43405 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COCHO43405 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COCHO43405 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COCHO43405 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COCHO43405 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COCHO43405 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COCHO43405 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms