Protein–RNA interactions for Protein: O43307

ARHGEF9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF9O43307 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGEF9O43307 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGEF9O43307 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGEF9O43307 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF9O43307 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF9O43307 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF9O43307 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGEF9O43307 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGEF9O43307 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGEF9O43307 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF9O43307 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGEF9O43307 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARHGEF9O43307 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGEF9O43307 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGEF9O43307 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGEF9O43307 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGEF9O43307 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGEF9O43307 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGEF9O43307 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF9O43307 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF9O43307 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF9O43307 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF9O43307 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF9O43307 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF9O43307 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF9O43307 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARHGEF9O43307 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARHGEF9O43307 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF9O43307 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF9O43307 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF9O43307 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF9O43307 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF9O43307 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF9O43307 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF9O43307 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF9O43307 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF9O43307 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF9O43307 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF9O43307 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF9O43307 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGEF9O43307 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARHGEF9O43307 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF9O43307 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF9O43307 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF9O43307 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF9O43307 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF9O43307 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGEF9O43307 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGEF9O43307 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF9O43307 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF9O43307 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF9O43307 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGEF9O43307 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGEF9O43307 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGEF9O43307 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF9O43307 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF9O43307 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF9O43307 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARHGEF9O43307 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARHGEF9O43307 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF9O43307 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF9O43307 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF9O43307 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF9O43307 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF9O43307 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF9O43307 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF9O43307 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF9O43307 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF9O43307 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF9O43307 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF9O43307 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF9O43307 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF9O43307 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF9O43307 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF9O43307 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF9O43307 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF9O43307 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF9O43307 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF9O43307 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF9O43307 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF9O43307 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF9O43307 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF9O43307 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF9O43307 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF9O43307 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF9O43307 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF9O43307 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF9O43307 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF9O43307 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF9O43307 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGEF9O43307 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGEF9O43307 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGEF9O43307 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF9O43307 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF9O43307 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF9O43307 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF9O43307 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF9O43307 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF9O43307 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF9O43307 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7 ms