Protein–RNA interactions for Protein: O15534

PER1, Period circadian protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER1O15534 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
PER1O15534 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.57
PER1O15534 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.57
PER1O15534 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
PER1O15534 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PER1O15534 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PER1O15534 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PER1O15534 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PER1O15534 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PER1O15534 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PER1O15534 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PER1O15534 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PER1O15534 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PER1O15534 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
PER1O15534 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
PER1O15534 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PER1O15534 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PER1O15534 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PER1O15534 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PER1O15534 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PER1O15534 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PER1O15534 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PER1O15534 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PER1O15534 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
PER1O15534 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PER1O15534 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PER1O15534 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PER1O15534 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PER1O15534 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PER1O15534 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PER1O15534 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PER1O15534 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PER1O15534 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PER1O15534 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PER1O15534 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PER1O15534 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PER1O15534 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PER1O15534 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PER1O15534 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PER1O15534 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PER1O15534 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PER1O15534 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PER1O15534 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PER1O15534 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PER1O15534 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PER1O15534 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PER1O15534 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PER1O15534 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PER1O15534 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PER1O15534 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PER1O15534 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PER1O15534 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PER1O15534 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PER1O15534 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PER1O15534 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PER1O15534 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PER1O15534 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PER1O15534 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PER1O15534 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
PER1O15534 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
PER1O15534 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PER1O15534 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PER1O15534 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PER1O15534 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PER1O15534 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PER1O15534 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PER1O15534 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PER1O15534 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PER1O15534 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PER1O15534 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PER1O15534 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PER1O15534 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PER1O15534 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PER1O15534 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PER1O15534 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PER1O15534 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PER1O15534 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PER1O15534 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PER1O15534 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PER1O15534 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PER1O15534 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PER1O15534 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PER1O15534 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
PER1O15534 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PER1O15534 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PER1O15534 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PER1O15534 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PER1O15534 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PER1O15534 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PER1O15534 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PER1O15534 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PER1O15534 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
PER1O15534 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PER1O15534 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PER1O15534 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PER1O15534 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PER1O15534 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
PER1O15534 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PER1O15534 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PER1O15534 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms