Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
SEMA3EO15041 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
SEMA3EO15041 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SEMA3EO15041 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SEMA3EO15041 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SEMA3EO15041 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SEMA3EO15041 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SEMA3EO15041 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SEMA3EO15041 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SEMA3EO15041 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SEMA3EO15041 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SEMA3EO15041 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SEMA3EO15041 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SEMA3EO15041 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
SEMA3EO15041 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SEMA3EO15041 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
SEMA3EO15041 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SEMA3EO15041 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SEMA3EO15041 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SEMA3EO15041 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SEMA3EO15041 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SEMA3EO15041 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SEMA3EO15041 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SEMA3EO15041 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SEMA3EO15041 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SEMA3EO15041 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SEMA3EO15041 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
SEMA3EO15041 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SEMA3EO15041 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SEMA3EO15041 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SEMA3EO15041 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SEMA3EO15041 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SEMA3EO15041 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SEMA3EO15041 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SEMA3EO15041 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SEMA3EO15041 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SEMA3EO15041 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SEMA3EO15041 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SEMA3EO15041 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SEMA3EO15041 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SEMA3EO15041 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SEMA3EO15041 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SEMA3EO15041 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
SEMA3EO15041 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
SEMA3EO15041 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SEMA3EO15041 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SEMA3EO15041 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SEMA3EO15041 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SEMA3EO15041 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SEMA3EO15041 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
SEMA3EO15041 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SEMA3EO15041 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SEMA3EO15041 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SEMA3EO15041 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
SEMA3EO15041 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SEMA3EO15041 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SEMA3EO15041 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SEMA3EO15041 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SEMA3EO15041 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SEMA3EO15041 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SEMA3EO15041 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SEMA3EO15041 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SEMA3EO15041 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SEMA3EO15041 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SEMA3EO15041 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SEMA3EO15041 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SEMA3EO15041 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SEMA3EO15041 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
SEMA3EO15041 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SEMA3EO15041 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SEMA3EO15041 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SEMA3EO15041 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SEMA3EO15041 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SEMA3EO15041 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SEMA3EO15041 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SEMA3EO15041 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SEMA3EO15041 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SEMA3EO15041 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SEMA3EO15041 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SEMA3EO15041 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SEMA3EO15041 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SEMA3EO15041 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SEMA3EO15041 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SEMA3EO15041 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SEMA3EO15041 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SEMA3EO15041 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SEMA3EO15041 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SEMA3EO15041 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SEMA3EO15041 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SEMA3EO15041 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SEMA3EO15041 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SEMA3EO15041 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SEMA3EO15041 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SEMA3EO15041 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SEMA3EO15041 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SEMA3EO15041 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SEMA3EO15041 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SEMA3EO15041 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SEMA3EO15041 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SEMA3EO15041 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms