Protein–RNA interactions for Protein: O15014

ZNF609, Zinc finger protein 609, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF609O15014 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ZNF609O15014 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ZNF609O15014 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ZNF609O15014 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.79■■■■□ 3
ZNF609O15014 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ZNF609O15014 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
ZNF609O15014 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ZNF609O15014 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ZNF609O15014 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ZNF609O15014 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.77■■■■□ 3
ZNF609O15014 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ZNF609O15014 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ZNF609O15014 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZNF609O15014 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZNF609O15014 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ZNF609O15014 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ZNF609O15014 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ZNF609O15014 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ZNF609O15014 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZNF609O15014 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZNF609O15014 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZNF609O15014 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZNF609O15014 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZNF609O15014 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZNF609O15014 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZNF609O15014 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ZNF609O15014 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
ZNF609O15014 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
ZNF609O15014 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
ZNF609O15014 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZNF609O15014 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ZNF609O15014 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ZNF609O15014 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
ZNF609O15014 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ZNF609O15014 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ZNF609O15014 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ZNF609O15014 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ZNF609O15014 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ZNF609O15014 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ZNF609O15014 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
ZNF609O15014 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
ZNF609O15014 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ZNF609O15014 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ZNF609O15014 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ZNF609O15014 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ZNF609O15014 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ZNF609O15014 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ZNF609O15014 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ZNF609O15014 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ZNF609O15014 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ZNF609O15014 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ZNF609O15014 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ZNF609O15014 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ZNF609O15014 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ZNF609O15014 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ZNF609O15014 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ZNF609O15014 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ZNF609O15014 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ZNF609O15014 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNF609O15014 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNF609O15014 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNF609O15014 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZNF609O15014 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ZNF609O15014 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ZNF609O15014 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ZNF609O15014 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZNF609O15014 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZNF609O15014 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZNF609O15014 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF609O15014 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZNF609O15014 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ZNF609O15014 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF609O15014 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF609O15014 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF609O15014 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF609O15014 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF609O15014 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF609O15014 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF609O15014 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF609O15014 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF609O15014 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF609O15014 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF609O15014 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF609O15014 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
ZNF609O15014 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF609O15014 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ZNF609O15014 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ZNF609O15014 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ZNF609O15014 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ZNF609O15014 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZNF609O15014 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZNF609O15014 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZNF609O15014 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZNF609O15014 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNF609O15014 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNF609O15014 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ZNF609O15014 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ZNF609O15014 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF609O15014 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZNF609O15014 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms