Protein–RNA interactions for Protein: O14827

RASGRF2, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF2O14827 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RASGRF2O14827 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RASGRF2O14827 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RASGRF2O14827 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RASGRF2O14827 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RASGRF2O14827 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RASGRF2O14827 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RASGRF2O14827 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RASGRF2O14827 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RASGRF2O14827 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RASGRF2O14827 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RASGRF2O14827 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RASGRF2O14827 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RASGRF2O14827 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RASGRF2O14827 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RASGRF2O14827 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RASGRF2O14827 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RASGRF2O14827 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RASGRF2O14827 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RASGRF2O14827 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RASGRF2O14827 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RASGRF2O14827 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RASGRF2O14827 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RASGRF2O14827 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RASGRF2O14827 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RASGRF2O14827 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RASGRF2O14827 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RASGRF2O14827 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RASGRF2O14827 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RASGRF2O14827 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RASGRF2O14827 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RASGRF2O14827 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RASGRF2O14827 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RASGRF2O14827 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RASGRF2O14827 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RASGRF2O14827 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RASGRF2O14827 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RASGRF2O14827 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RASGRF2O14827 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RASGRF2O14827 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RASGRF2O14827 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RASGRF2O14827 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RASGRF2O14827 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RASGRF2O14827 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RASGRF2O14827 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RASGRF2O14827 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RASGRF2O14827 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RASGRF2O14827 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RASGRF2O14827 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RASGRF2O14827 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RASGRF2O14827 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RASGRF2O14827 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RASGRF2O14827 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RASGRF2O14827 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RASGRF2O14827 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RASGRF2O14827 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RASGRF2O14827 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RASGRF2O14827 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RASGRF2O14827 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RASGRF2O14827 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RASGRF2O14827 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RASGRF2O14827 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RASGRF2O14827 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RASGRF2O14827 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RASGRF2O14827 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RASGRF2O14827 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RASGRF2O14827 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RASGRF2O14827 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RASGRF2O14827 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RASGRF2O14827 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RASGRF2O14827 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RASGRF2O14827 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RASGRF2O14827 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RASGRF2O14827 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RASGRF2O14827 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RASGRF2O14827 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RASGRF2O14827 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RASGRF2O14827 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RASGRF2O14827 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RASGRF2O14827 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RASGRF2O14827 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RASGRF2O14827 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RASGRF2O14827 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RASGRF2O14827 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASGRF2O14827 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASGRF2O14827 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASGRF2O14827 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RASGRF2O14827 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RASGRF2O14827 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RASGRF2O14827 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RASGRF2O14827 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RASGRF2O14827 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASGRF2O14827 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASGRF2O14827 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASGRF2O14827 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASGRF2O14827 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASGRF2O14827 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASGRF2O14827 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASGRF2O14827 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RASGRF2O14827 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms