Protein–RNA interactions for Protein: O14598

VCY, Testis-specific basic protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCYO14598 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
VCYO14598 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
VCYO14598 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VCYO14598 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VCYO14598 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VCYO14598 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VCYO14598 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VCYO14598 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VCYO14598 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VCYO14598 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VCYO14598 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VCYO14598 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VCYO14598 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VCYO14598 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VCYO14598 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VCYO14598 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VCYO14598 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VCYO14598 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VCYO14598 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VCYO14598 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCYO14598 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCYO14598 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCYO14598 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCYO14598 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCYO14598 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCYO14598 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCYO14598 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VCYO14598 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VCYO14598 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VCYO14598 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VCYO14598 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VCYO14598 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VCYO14598 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VCYO14598 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VCYO14598 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VCYO14598 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VCYO14598 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
VCYO14598 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VCYO14598 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VCYO14598 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VCYO14598 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VCYO14598 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VCYO14598 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VCYO14598 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VCYO14598 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VCYO14598 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCYO14598 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCYO14598 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCYO14598 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCYO14598 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCYO14598 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCYO14598 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCYO14598 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
VCYO14598 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCYO14598 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCYO14598 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCYO14598 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCYO14598 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VCYO14598 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VCYO14598 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VCYO14598 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCYO14598 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCYO14598 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCYO14598 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCYO14598 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCYO14598 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCYO14598 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCYO14598 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCYO14598 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCYO14598 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCYO14598 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCYO14598 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCYO14598 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCYO14598 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCYO14598 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCYO14598 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCYO14598 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCYO14598 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VCYO14598 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VCYO14598 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VCYO14598 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCYO14598 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCYO14598 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCYO14598 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCYO14598 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCYO14598 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCYO14598 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCYO14598 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCYO14598 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCYO14598 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCYO14598 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCYO14598 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VCYO14598 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VCYO14598 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VCYO14598 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VCYO14598 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VCYO14598 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VCYO14598 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
VCYO14598 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VCYO14598 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms