Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TXNDC9O14530 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TXNDC9O14530 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TXNDC9O14530 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TXNDC9O14530 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TXNDC9O14530 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TXNDC9O14530 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TXNDC9O14530 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TXNDC9O14530 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TXNDC9O14530 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TXNDC9O14530 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TXNDC9O14530 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TXNDC9O14530 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TXNDC9O14530 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TXNDC9O14530 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TXNDC9O14530 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TXNDC9O14530 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TXNDC9O14530 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TXNDC9O14530 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TXNDC9O14530 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TXNDC9O14530 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TXNDC9O14530 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TXNDC9O14530 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TXNDC9O14530 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TXNDC9O14530 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TXNDC9O14530 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TXNDC9O14530 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TXNDC9O14530 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TXNDC9O14530 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TXNDC9O14530 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TXNDC9O14530 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TXNDC9O14530 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TXNDC9O14530 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TXNDC9O14530 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TXNDC9O14530 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TXNDC9O14530 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNDC9O14530 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNDC9O14530 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNDC9O14530 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNDC9O14530 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNDC9O14530 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TXNDC9O14530 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TXNDC9O14530 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TXNDC9O14530 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TXNDC9O14530 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TXNDC9O14530 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TXNDC9O14530 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TXNDC9O14530 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TXNDC9O14530 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TXNDC9O14530 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TXNDC9O14530 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TXNDC9O14530 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TXNDC9O14530 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TXNDC9O14530 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TXNDC9O14530 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TXNDC9O14530 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TXNDC9O14530 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TXNDC9O14530 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TXNDC9O14530 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TXNDC9O14530 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TXNDC9O14530 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TXNDC9O14530 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TXNDC9O14530 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TXNDC9O14530 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TXNDC9O14530 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TXNDC9O14530 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TXNDC9O14530 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TXNDC9O14530 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TXNDC9O14530 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TXNDC9O14530 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TXNDC9O14530 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TXNDC9O14530 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TXNDC9O14530 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TXNDC9O14530 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TXNDC9O14530 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TXNDC9O14530 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TXNDC9O14530 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TXNDC9O14530 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TXNDC9O14530 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TXNDC9O14530 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TXNDC9O14530 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TXNDC9O14530 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TXNDC9O14530 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TXNDC9O14530 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TXNDC9O14530 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TXNDC9O14530 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TXNDC9O14530 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TXNDC9O14530 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TXNDC9O14530 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TXNDC9O14530 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TXNDC9O14530 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TXNDC9O14530 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TXNDC9O14530 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TXNDC9O14530 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TXNDC9O14530 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TXNDC9O14530 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TXNDC9O14530 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TXNDC9O14530 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TXNDC9O14530 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TXNDC9O14530 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms