Protein–RNA interactions for Protein: O00300

TNFRSF11B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11B, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF11BO00300 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF11BO00300 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF11BO00300 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF11BO00300 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF11BO00300 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF11BO00300 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF11BO00300 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF11BO00300 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF11BO00300 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF11BO00300 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF11BO00300 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF11BO00300 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF11BO00300 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF11BO00300 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF11BO00300 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF11BO00300 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF11BO00300 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF11BO00300 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF11BO00300 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF11BO00300 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF11BO00300 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNFRSF11BO00300 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNFRSF11BO00300 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF11BO00300 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF11BO00300 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF11BO00300 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF11BO00300 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11BO00300 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11BO00300 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11BO00300 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11BO00300 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11BO00300 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11BO00300 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11BO00300 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11BO00300 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF11BO00300 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF11BO00300 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF11BO00300 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF11BO00300 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF11BO00300 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF11BO00300 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF11BO00300 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFRSF11BO00300 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFRSF11BO00300 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFRSF11BO00300 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFRSF11BO00300 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFRSF11BO00300 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF11BO00300 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF11BO00300 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF11BO00300 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF11BO00300 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF11BO00300 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF11BO00300 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF11BO00300 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF11BO00300 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF11BO00300 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNFRSF11BO00300 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF11BO00300 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF11BO00300 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF11BO00300 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF11BO00300 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF11BO00300 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF11BO00300 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF11BO00300 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF11BO00300 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF11BO00300 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF11BO00300 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF11BO00300 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF11BO00300 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF11BO00300 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF11BO00300 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF11BO00300 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF11BO00300 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF11BO00300 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF11BO00300 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF11BO00300 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF11BO00300 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF11BO00300 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF11BO00300 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF11BO00300 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF11BO00300 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF11BO00300 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF11BO00300 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF11BO00300 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF11BO00300 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF11BO00300 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF11BO00300 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF11BO00300 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF11BO00300 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF11BO00300 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF11BO00300 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF11BO00300 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF11BO00300 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF11BO00300 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF11BO00300 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF11BO00300 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF11BO00300 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF11BO00300 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF11BO00300 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF11BO00300 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms