Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
DFFAO00273 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DFFAO00273 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DFFAO00273 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DFFAO00273 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DFFAO00273 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DFFAO00273 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DFFAO00273 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DFFAO00273 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DFFAO00273 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DFFAO00273 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DFFAO00273 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DFFAO00273 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DFFAO00273 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DFFAO00273 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DFFAO00273 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DFFAO00273 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DFFAO00273 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DFFAO00273 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DFFAO00273 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DFFAO00273 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DFFAO00273 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DFFAO00273 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
DFFAO00273 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DFFAO00273 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DFFAO00273 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DFFAO00273 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DFFAO00273 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DFFAO00273 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DFFAO00273 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DFFAO00273 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DFFAO00273 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DFFAO00273 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DFFAO00273 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DFFAO00273 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DFFAO00273 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DFFAO00273 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DFFAO00273 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DFFAO00273 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DFFAO00273 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DFFAO00273 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DFFAO00273 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DFFAO00273 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DFFAO00273 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DFFAO00273 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DFFAO00273 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DFFAO00273 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DFFAO00273 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DFFAO00273 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DFFAO00273 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DFFAO00273 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DFFAO00273 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
DFFAO00273 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DFFAO00273 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DFFAO00273 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DFFAO00273 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DFFAO00273 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DFFAO00273 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DFFAO00273 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DFFAO00273 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DFFAO00273 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DFFAO00273 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DFFAO00273 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DFFAO00273 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DFFAO00273 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DFFAO00273 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DFFAO00273 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DFFAO00273 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DFFAO00273 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
DFFAO00273 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DFFAO00273 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DFFAO00273 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DFFAO00273 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DFFAO00273 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DFFAO00273 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DFFAO00273 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DFFAO00273 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DFFAO00273 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DFFAO00273 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DFFAO00273 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DFFAO00273 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DFFAO00273 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DFFAO00273 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DFFAO00273 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DFFAO00273 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DFFAO00273 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DFFAO00273 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DFFAO00273 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DFFAO00273 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DFFAO00273 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DFFAO00273 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DFFAO00273 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DFFAO00273 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DFFAO00273 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DFFAO00273 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DFFAO00273 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DFFAO00273 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DFFAO00273 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DFFAO00273 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DFFAO00273 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms