Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN34H7C241 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN34H7C241 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN34H7C241 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN34H7C241 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN34H7C241 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN34H7C241 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN34H7C241 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN34H7C241 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN34H7C241 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN34H7C241 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN34H7C241 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN34H7C241 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN34H7C241 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN34H7C241 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN34H7C241 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN34H7C241 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN34H7C241 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN34H7C241 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN34H7C241 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN34H7C241 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN34H7C241 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN34H7C241 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN34H7C241 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN34H7C241 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN34H7C241 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN34H7C241 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN34H7C241 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN34H7C241 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN34H7C241 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN34H7C241 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN34H7C241 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN34H7C241 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN34H7C241 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN34H7C241 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN34H7C241 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN34H7C241 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN34H7C241 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN34H7C241 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN34H7C241 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN34H7C241 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN34H7C241 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN34H7C241 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN34H7C241 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN34H7C241 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN34H7C241 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN34H7C241 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN34H7C241 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN34H7C241 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN34H7C241 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN34H7C241 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN34H7C241 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN34H7C241 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN34H7C241 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN34H7C241 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN34H7C241 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN34H7C241 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN34H7C241 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN34H7C241 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN34H7C241 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN34H7C241 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN34H7C241 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN34H7C241 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN34H7C241 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN34H7C241 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN34H7C241 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN34H7C241 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN34H7C241 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN34H7C241 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN34H7C241 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN34H7C241 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN34H7C241 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN34H7C241 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN34H7C241 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN34H7C241 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN34H7C241 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN34H7C241 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN34H7C241 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN34H7C241 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN34H7C241 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN34H7C241 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN34H7C241 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN34H7C241 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN34H7C241 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLDN34H7C241 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLDN34H7C241 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN34H7C241 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN34H7C241 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN34H7C241 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN34H7C241 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN34H7C241 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN34H7C241 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN34H7C241 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN34H7C241 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN34H7C241 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN34H7C241 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN34H7C241 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN34H7C241 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN34H7C241 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN34H7C241 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms