Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA8SH3BPF8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GOLGA8SH3BPF8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA8SH3BPF8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA8SH3BPF8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA8SH3BPF8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA8SH3BPF8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLGA8SH3BPF8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA8SH3BPF8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA8SH3BPF8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA8SH3BPF8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA8SH3BPF8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA8SH3BPF8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA8SH3BPF8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA8SH3BPF8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA8SH3BPF8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA8SH3BPF8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GOLGA8SH3BPF8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOLGA8SH3BPF8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOLGA8SH3BPF8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GOLGA8SH3BPF8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GOLGA8SH3BPF8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GOLGA8SH3BPF8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GOLGA8SH3BPF8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GOLGA8SH3BPF8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLGA8SH3BPF8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GOLGA8SH3BPF8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GOLGA8SH3BPF8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GOLGA8SH3BPF8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GOLGA8SH3BPF8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GOLGA8SH3BPF8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLGA8SH3BPF8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLGA8SH3BPF8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLGA8SH3BPF8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA8SH3BPF8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLGA8SH3BPF8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA8SH3BPF8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA8SH3BPF8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA8SH3BPF8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA8SH3BPF8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA8SH3BPF8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA8SH3BPF8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GOLGA8SH3BPF8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA8SH3BPF8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA8SH3BPF8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA8SH3BPF8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA8SH3BPF8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA8SH3BPF8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA8SH3BPF8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA8SH3BPF8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA8SH3BPF8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA8SH3BPF8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA8SH3BPF8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA8SH3BPF8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA8SH3BPF8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA8SH3BPF8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA8SH3BPF8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA8SH3BPF8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA8SH3BPF8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA8SH3BPF8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA8SH3BPF8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA8SH3BPF8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA8SH3BPF8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA8SH3BPF8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA8SH3BPF8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA8SH3BPF8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA8SH3BPF8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA8SH3BPF8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA8SH3BPF8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA8SH3BPF8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA8SH3BPF8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA8SH3BPF8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA8SH3BPF8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA8SH3BPF8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA8SH3BPF8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA8SH3BPF8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA8SH3BPF8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA8SH3BPF8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA8SH3BPF8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA8SH3BPF8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA8SH3BPF8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA8SH3BPF8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA8SH3BPF8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA8SH3BPF8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA8SH3BPF8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA8SH3BPF8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA8SH3BPF8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA8SH3BPF8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA8SH3BPF8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA8SH3BPF8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA8SH3BPF8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA8SH3BPF8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA8SH3BPF8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA8SH3BPF8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA8SH3BPF8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA8SH3BPF8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA8SH3BPF8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA8SH3BPF8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA8SH3BPF8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms