Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
F8VP50 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
F8VP50 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
F8VP50 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
F8VP50 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
F8VP50 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
F8VP50 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
F8VP50 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
F8VP50 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
F8VP50 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
F8VP50 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
F8VP50 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
F8VP50 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
F8VP50 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
F8VP50 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
F8VP50 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
F8VP50 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
F8VP50 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
F8VP50 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
F8VP50 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
F8VP50 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
F8VP50 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
F8VP50 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
F8VP50 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
F8VP50 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
F8VP50 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
F8VP50 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
F8VP50 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
F8VP50 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
F8VP50 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
F8VP50 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
F8VP50 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
F8VP50 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
F8VP50 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
F8VP50 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
F8VP50 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
F8VP50 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
F8VP50 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
F8VP50 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
F8VP50 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
F8VP50 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
F8VP50 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
F8VP50 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
F8VP50 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
F8VP50 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
F8VP50 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
F8VP50 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
F8VP50 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
F8VP50 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
F8VP50 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
F8VP50 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
F8VP50 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
F8VP50 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
F8VP50 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
F8VP50 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
F8VP50 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
F8VP50 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
F8VP50 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
F8VP50 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
F8VP50 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
F8VP50 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
F8VP50 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
F8VP50 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
F8VP50 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
F8VP50 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
F8VP50 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
F8VP50 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
F8VP50 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
F8VP50 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
F8VP50 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
F8VP50 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
F8VP50 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
F8VP50 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
F8VP50 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
F8VP50 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
F8VP50 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
F8VP50 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
F8VP50 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
F8VP50 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
F8VP50 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
F8VP50 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
F8VP50 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
F8VP50 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
F8VP50 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
F8VP50 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
F8VP50 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
F8VP50 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
F8VP50 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
F8VP50 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
F8VP50 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
F8VP50 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
F8VP50 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
F8VP50 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
F8VP50 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
F8VP50 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
F8VP50 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
F8VP50 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
F8VP50 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
F8VP50 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
F8VP50 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms