Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IQCJ-SCHIP1C9J366 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IQCJ-SCHIP1C9J366 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IQCJ-SCHIP1C9J366 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IQCJ-SCHIP1C9J366 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
IQCJ-SCHIP1C9J366 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IQCJ-SCHIP1C9J366 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IQCJ-SCHIP1C9J366 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IQCJ-SCHIP1C9J366 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
IQCJ-SCHIP1C9J366 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
IQCJ-SCHIP1C9J366 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IQCJ-SCHIP1C9J366 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IQCJ-SCHIP1C9J366 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IQCJ-SCHIP1C9J366 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IQCJ-SCHIP1C9J366 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IQCJ-SCHIP1C9J366 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IQCJ-SCHIP1C9J366 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IQCJ-SCHIP1C9J366 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IQCJ-SCHIP1C9J366 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IQCJ-SCHIP1C9J366 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IQCJ-SCHIP1C9J366 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IQCJ-SCHIP1C9J366 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IQCJ-SCHIP1C9J366 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IQCJ-SCHIP1C9J366 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IQCJ-SCHIP1C9J366 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IQCJ-SCHIP1C9J366 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
IQCJ-SCHIP1C9J366 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IQCJ-SCHIP1C9J366 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IQCJ-SCHIP1C9J366 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IQCJ-SCHIP1C9J366 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IQCJ-SCHIP1C9J366 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IQCJ-SCHIP1C9J366 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IQCJ-SCHIP1C9J366 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IQCJ-SCHIP1C9J366 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IQCJ-SCHIP1C9J366 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IQCJ-SCHIP1C9J366 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IQCJ-SCHIP1C9J366 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IQCJ-SCHIP1C9J366 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IQCJ-SCHIP1C9J366 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IQCJ-SCHIP1C9J366 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IQCJ-SCHIP1C9J366 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IQCJ-SCHIP1C9J366 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IQCJ-SCHIP1C9J366 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IQCJ-SCHIP1C9J366 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IQCJ-SCHIP1C9J366 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IQCJ-SCHIP1C9J366 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IQCJ-SCHIP1C9J366 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IQCJ-SCHIP1C9J366 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IQCJ-SCHIP1C9J366 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IQCJ-SCHIP1C9J366 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IQCJ-SCHIP1C9J366 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IQCJ-SCHIP1C9J366 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IQCJ-SCHIP1C9J366 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IQCJ-SCHIP1C9J366 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IQCJ-SCHIP1C9J366 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IQCJ-SCHIP1C9J366 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IQCJ-SCHIP1C9J366 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IQCJ-SCHIP1C9J366 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IQCJ-SCHIP1C9J366 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IQCJ-SCHIP1C9J366 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IQCJ-SCHIP1C9J366 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IQCJ-SCHIP1C9J366 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
IQCJ-SCHIP1C9J366 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IQCJ-SCHIP1C9J366 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IQCJ-SCHIP1C9J366 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IQCJ-SCHIP1C9J366 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IQCJ-SCHIP1C9J366 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IQCJ-SCHIP1C9J366 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IQCJ-SCHIP1C9J366 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IQCJ-SCHIP1C9J366 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IQCJ-SCHIP1C9J366 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IQCJ-SCHIP1C9J366 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IQCJ-SCHIP1C9J366 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
IQCJ-SCHIP1C9J366 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7 ms