Protein–RNA interactions for Protein: B4DS77

SHISA9, Protein shisa-9, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA9B4DS77 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHISA9B4DS77 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHISA9B4DS77 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SHISA9B4DS77 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHISA9B4DS77 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHISA9B4DS77 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHISA9B4DS77 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHISA9B4DS77 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHISA9B4DS77 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHISA9B4DS77 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHISA9B4DS77 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHISA9B4DS77 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHISA9B4DS77 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHISA9B4DS77 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHISA9B4DS77 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SHISA9B4DS77 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SHISA9B4DS77 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHISA9B4DS77 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHISA9B4DS77 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHISA9B4DS77 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHISA9B4DS77 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHISA9B4DS77 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHISA9B4DS77 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHISA9B4DS77 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHISA9B4DS77 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHISA9B4DS77 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHISA9B4DS77 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHISA9B4DS77 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHISA9B4DS77 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHISA9B4DS77 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHISA9B4DS77 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHISA9B4DS77 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHISA9B4DS77 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHISA9B4DS77 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHISA9B4DS77 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHISA9B4DS77 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHISA9B4DS77 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHISA9B4DS77 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHISA9B4DS77 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHISA9B4DS77 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SHISA9B4DS77 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHISA9B4DS77 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHISA9B4DS77 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHISA9B4DS77 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHISA9B4DS77 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHISA9B4DS77 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHISA9B4DS77 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHISA9B4DS77 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHISA9B4DS77 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHISA9B4DS77 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHISA9B4DS77 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHISA9B4DS77 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHISA9B4DS77 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHISA9B4DS77 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHISA9B4DS77 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHISA9B4DS77 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHISA9B4DS77 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHISA9B4DS77 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHISA9B4DS77 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHISA9B4DS77 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHISA9B4DS77 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHISA9B4DS77 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHISA9B4DS77 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHISA9B4DS77 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHISA9B4DS77 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SHISA9B4DS77 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHISA9B4DS77 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHISA9B4DS77 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHISA9B4DS77 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHISA9B4DS77 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SHISA9B4DS77 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHISA9B4DS77 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHISA9B4DS77 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHISA9B4DS77 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHISA9B4DS77 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHISA9B4DS77 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHISA9B4DS77 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHISA9B4DS77 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHISA9B4DS77 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHISA9B4DS77 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHISA9B4DS77 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHISA9B4DS77 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHISA9B4DS77 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA9B4DS77 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA9B4DS77 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA9B4DS77 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA9B4DS77 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHISA9B4DS77 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHISA9B4DS77 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHISA9B4DS77 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHISA9B4DS77 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHISA9B4DS77 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHISA9B4DS77 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHISA9B4DS77 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHISA9B4DS77 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHISA9B4DS77 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHISA9B4DS77 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SHISA9B4DS77 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHISA9B4DS77 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHISA9B4DS77 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms