Protein–RNA interactions for Protein: A8MV24

C17orf98, Uncharacterized protein C17orf98, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf98A8MV24 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C17orf98A8MV24 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C17orf98A8MV24 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C17orf98A8MV24 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C17orf98A8MV24 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C17orf98A8MV24 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C17orf98A8MV24 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C17orf98A8MV24 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C17orf98A8MV24 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
C17orf98A8MV24 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
C17orf98A8MV24 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C17orf98A8MV24 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C17orf98A8MV24 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C17orf98A8MV24 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C17orf98A8MV24 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C17orf98A8MV24 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C17orf98A8MV24 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C17orf98A8MV24 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C17orf98A8MV24 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C17orf98A8MV24 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf98A8MV24 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf98A8MV24 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf98A8MV24 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C17orf98A8MV24 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C17orf98A8MV24 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C17orf98A8MV24 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C17orf98A8MV24 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf98A8MV24 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf98A8MV24 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf98A8MV24 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf98A8MV24 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf98A8MV24 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf98A8MV24 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf98A8MV24 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf98A8MV24 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf98A8MV24 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf98A8MV24 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf98A8MV24 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf98A8MV24 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf98A8MV24 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf98A8MV24 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf98A8MV24 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf98A8MV24 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf98A8MV24 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C17orf98A8MV24 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C17orf98A8MV24 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C17orf98A8MV24 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C17orf98A8MV24 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C17orf98A8MV24 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C17orf98A8MV24 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf98A8MV24 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf98A8MV24 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C17orf98A8MV24 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C17orf98A8MV24 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C17orf98A8MV24 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C17orf98A8MV24 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C17orf98A8MV24 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C17orf98A8MV24 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C17orf98A8MV24 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C17orf98A8MV24 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C17orf98A8MV24 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C17orf98A8MV24 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C17orf98A8MV24 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C17orf98A8MV24 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C17orf98A8MV24 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C17orf98A8MV24 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C17orf98A8MV24 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C17orf98A8MV24 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C17orf98A8MV24 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C17orf98A8MV24 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C17orf98A8MV24 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C17orf98A8MV24 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C17orf98A8MV24 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf98A8MV24 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf98A8MV24 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf98A8MV24 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf98A8MV24 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf98A8MV24 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C17orf98A8MV24 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf98A8MV24 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf98A8MV24 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf98A8MV24 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf98A8MV24 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf98A8MV24 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf98A8MV24 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf98A8MV24 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf98A8MV24 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf98A8MV24 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C17orf98A8MV24 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C17orf98A8MV24 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C17orf98A8MV24 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C17orf98A8MV24 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C17orf98A8MV24 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C17orf98A8MV24 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C17orf98A8MV24 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C17orf98A8MV24 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C17orf98A8MV24 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf98A8MV24 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf98A8MV24 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C17orf98A8MV24 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms