Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ11

PMS2P5, Postmeiotic segregation increased 2-like protein 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P5A8MQ11 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMS2P5A8MQ11 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PMS2P5A8MQ11 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PMS2P5A8MQ11 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMS2P5A8MQ11 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMS2P5A8MQ11 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMS2P5A8MQ11 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMS2P5A8MQ11 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMS2P5A8MQ11 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMS2P5A8MQ11 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMS2P5A8MQ11 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PMS2P5A8MQ11 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMS2P5A8MQ11 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMS2P5A8MQ11 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMS2P5A8MQ11 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMS2P5A8MQ11 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PMS2P5A8MQ11 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMS2P5A8MQ11 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMS2P5A8MQ11 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMS2P5A8MQ11 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PMS2P5A8MQ11 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PMS2P5A8MQ11 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PMS2P5A8MQ11 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMS2P5A8MQ11 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMS2P5A8MQ11 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMS2P5A8MQ11 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMS2P5A8MQ11 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PMS2P5A8MQ11 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PMS2P5A8MQ11 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PMS2P5A8MQ11 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMS2P5A8MQ11 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMS2P5A8MQ11 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMS2P5A8MQ11 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PMS2P5A8MQ11 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMS2P5A8MQ11 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMS2P5A8MQ11 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMS2P5A8MQ11 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMS2P5A8MQ11 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PMS2P5A8MQ11 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PMS2P5A8MQ11 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PMS2P5A8MQ11 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMS2P5A8MQ11 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PMS2P5A8MQ11 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMS2P5A8MQ11 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMS2P5A8MQ11 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMS2P5A8MQ11 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMS2P5A8MQ11 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMS2P5A8MQ11 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMS2P5A8MQ11 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMS2P5A8MQ11 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMS2P5A8MQ11 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMS2P5A8MQ11 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMS2P5A8MQ11 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS2P5A8MQ11 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS2P5A8MQ11 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS2P5A8MQ11 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS2P5A8MQ11 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS2P5A8MQ11 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS2P5A8MQ11 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS2P5A8MQ11 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS2P5A8MQ11 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS2P5A8MQ11 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS2P5A8MQ11 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS2P5A8MQ11 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS2P5A8MQ11 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS2P5A8MQ11 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS2P5A8MQ11 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMS2P5A8MQ11 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMS2P5A8MQ11 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMS2P5A8MQ11 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMS2P5A8MQ11 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMS2P5A8MQ11 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P5A8MQ11 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P5A8MQ11 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P5A8MQ11 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P5A8MQ11 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P5A8MQ11 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P5A8MQ11 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMS2P5A8MQ11 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMS2P5A8MQ11 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMS2P5A8MQ11 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMS2P5A8MQ11 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMS2P5A8MQ11 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMS2P5A8MQ11 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PMS2P5A8MQ11 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PMS2P5A8MQ11 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PMS2P5A8MQ11 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMS2P5A8MQ11 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMS2P5A8MQ11 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMS2P5A8MQ11 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMS2P5A8MQ11 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PMS2P5A8MQ11 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMS2P5A8MQ11 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMS2P5A8MQ11 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PMS2P5A8MQ11 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PMS2P5A8MQ11 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMS2P5A8MQ11 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PMS2P5A8MQ11 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMS2P5A8MQ11 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMS2P5A8MQ11 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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