Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ11

PMS2P5, Postmeiotic segregation increased 2-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P5A8MQ11 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PMS2P5A8MQ11 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PMS2P5A8MQ11 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PMS2P5A8MQ11 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PMS2P5A8MQ11 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMS2P5A8MQ11 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PMS2P5A8MQ11 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PMS2P5A8MQ11 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PMS2P5A8MQ11 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PMS2P5A8MQ11 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PMS2P5A8MQ11 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PMS2P5A8MQ11 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMS2P5A8MQ11 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMS2P5A8MQ11 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMS2P5A8MQ11 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMS2P5A8MQ11 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PMS2P5A8MQ11 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMS2P5A8MQ11 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMS2P5A8MQ11 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMS2P5A8MQ11 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMS2P5A8MQ11 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PMS2P5A8MQ11 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PMS2P5A8MQ11 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PMS2P5A8MQ11 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PMS2P5A8MQ11 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PMS2P5A8MQ11 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMS2P5A8MQ11 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PMS2P5A8MQ11 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PMS2P5A8MQ11 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMS2P5A8MQ11 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PMS2P5A8MQ11 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PMS2P5A8MQ11 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMS2P5A8MQ11 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS2P5A8MQ11 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS2P5A8MQ11 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS2P5A8MQ11 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS2P5A8MQ11 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS2P5A8MQ11 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMS2P5A8MQ11 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMS2P5A8MQ11 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS2P5A8MQ11 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMS2P5A8MQ11 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS2P5A8MQ11 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMS2P5A8MQ11 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMS2P5A8MQ11 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMS2P5A8MQ11 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMS2P5A8MQ11 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS2P5A8MQ11 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMS2P5A8MQ11 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PMS2P5A8MQ11 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PMS2P5A8MQ11 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PMS2P5A8MQ11 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PMS2P5A8MQ11 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PMS2P5A8MQ11 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PMS2P5A8MQ11 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PMS2P5A8MQ11 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMS2P5A8MQ11 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMS2P5A8MQ11 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMS2P5A8MQ11 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMS2P5A8MQ11 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PMS2P5A8MQ11 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PMS2P5A8MQ11 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS2P5A8MQ11 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS2P5A8MQ11 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS2P5A8MQ11 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS2P5A8MQ11 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS2P5A8MQ11 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS2P5A8MQ11 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS2P5A8MQ11 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS2P5A8MQ11 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS2P5A8MQ11 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS2P5A8MQ11 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PMS2P5A8MQ11 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS2P5A8MQ11 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS2P5A8MQ11 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P5A8MQ11 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P5A8MQ11 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P5A8MQ11 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMS2P5A8MQ11 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMS2P5A8MQ11 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMS2P5A8MQ11 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMS2P5A8MQ11 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P5A8MQ11 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS2P5A8MQ11 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS2P5A8MQ11 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS2P5A8MQ11 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS2P5A8MQ11 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS2P5A8MQ11 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS2P5A8MQ11 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS2P5A8MQ11 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMS2P5A8MQ11 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMS2P5A8MQ11 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMS2P5A8MQ11 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMS2P5A8MQ11 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMS2P5A8MQ11 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PMS2P5A8MQ11 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PMS2P5A8MQ11 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PMS2P5A8MQ11 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PMS2P5A8MQ11 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMS2P5A8MQ11 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
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