Protein–RNA interactions for Protein: A6NHL2

TUBAL3, Tubulin alpha chain-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBAL3A6NHL2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBAL3A6NHL2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBAL3A6NHL2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TUBAL3A6NHL2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBAL3A6NHL2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBAL3A6NHL2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBAL3A6NHL2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBAL3A6NHL2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBAL3A6NHL2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBAL3A6NHL2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBAL3A6NHL2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBAL3A6NHL2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBAL3A6NHL2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBAL3A6NHL2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBAL3A6NHL2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBAL3A6NHL2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBAL3A6NHL2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBAL3A6NHL2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBAL3A6NHL2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBAL3A6NHL2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBAL3A6NHL2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBAL3A6NHL2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBAL3A6NHL2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBAL3A6NHL2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBAL3A6NHL2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBAL3A6NHL2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBAL3A6NHL2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBAL3A6NHL2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBAL3A6NHL2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBAL3A6NHL2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBAL3A6NHL2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBAL3A6NHL2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBAL3A6NHL2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBAL3A6NHL2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBAL3A6NHL2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBAL3A6NHL2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBAL3A6NHL2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBAL3A6NHL2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBAL3A6NHL2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBAL3A6NHL2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBAL3A6NHL2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBAL3A6NHL2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBAL3A6NHL2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBAL3A6NHL2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBAL3A6NHL2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBAL3A6NHL2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBAL3A6NHL2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBAL3A6NHL2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBAL3A6NHL2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBAL3A6NHL2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBAL3A6NHL2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBAL3A6NHL2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBAL3A6NHL2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBAL3A6NHL2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TUBAL3A6NHL2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBAL3A6NHL2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBAL3A6NHL2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBAL3A6NHL2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBAL3A6NHL2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBAL3A6NHL2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBAL3A6NHL2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TUBAL3A6NHL2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBAL3A6NHL2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBAL3A6NHL2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBAL3A6NHL2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBAL3A6NHL2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBAL3A6NHL2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBAL3A6NHL2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBAL3A6NHL2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBAL3A6NHL2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBAL3A6NHL2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBAL3A6NHL2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBAL3A6NHL2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBAL3A6NHL2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBAL3A6NHL2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBAL3A6NHL2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBAL3A6NHL2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBAL3A6NHL2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBAL3A6NHL2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBAL3A6NHL2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBAL3A6NHL2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBAL3A6NHL2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBAL3A6NHL2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBAL3A6NHL2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBAL3A6NHL2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBAL3A6NHL2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBAL3A6NHL2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBAL3A6NHL2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBAL3A6NHL2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBAL3A6NHL2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBAL3A6NHL2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBAL3A6NHL2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBAL3A6NHL2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBAL3A6NHL2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBAL3A6NHL2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBAL3A6NHL2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBAL3A6NHL2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBAL3A6NHL2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBAL3A6NHL2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBAL3A6NHL2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms