Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WIPF3A6NGB9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WIPF3A6NGB9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
WIPF3A6NGB9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WIPF3A6NGB9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WIPF3A6NGB9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WIPF3A6NGB9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WIPF3A6NGB9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WIPF3A6NGB9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WIPF3A6NGB9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WIPF3A6NGB9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
WIPF3A6NGB9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
WIPF3A6NGB9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WIPF3A6NGB9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WIPF3A6NGB9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WIPF3A6NGB9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WIPF3A6NGB9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WIPF3A6NGB9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WIPF3A6NGB9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WIPF3A6NGB9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WIPF3A6NGB9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WIPF3A6NGB9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
WIPF3A6NGB9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
WIPF3A6NGB9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WIPF3A6NGB9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WIPF3A6NGB9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WIPF3A6NGB9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
WIPF3A6NGB9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
WIPF3A6NGB9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WIPF3A6NGB9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WIPF3A6NGB9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WIPF3A6NGB9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WIPF3A6NGB9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WIPF3A6NGB9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WIPF3A6NGB9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
WIPF3A6NGB9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WIPF3A6NGB9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WIPF3A6NGB9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WIPF3A6NGB9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WIPF3A6NGB9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WIPF3A6NGB9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WIPF3A6NGB9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WIPF3A6NGB9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WIPF3A6NGB9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WIPF3A6NGB9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WIPF3A6NGB9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WIPF3A6NGB9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WIPF3A6NGB9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WIPF3A6NGB9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WIPF3A6NGB9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WIPF3A6NGB9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WIPF3A6NGB9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WIPF3A6NGB9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WIPF3A6NGB9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WIPF3A6NGB9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WIPF3A6NGB9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WIPF3A6NGB9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WIPF3A6NGB9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
WIPF3A6NGB9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WIPF3A6NGB9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WIPF3A6NGB9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WIPF3A6NGB9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WIPF3A6NGB9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WIPF3A6NGB9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WIPF3A6NGB9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WIPF3A6NGB9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WIPF3A6NGB9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WIPF3A6NGB9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WIPF3A6NGB9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WIPF3A6NGB9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WIPF3A6NGB9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WIPF3A6NGB9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WIPF3A6NGB9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WIPF3A6NGB9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WIPF3A6NGB9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WIPF3A6NGB9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WIPF3A6NGB9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
WIPF3A6NGB9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WIPF3A6NGB9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WIPF3A6NGB9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WIPF3A6NGB9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WIPF3A6NGB9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WIPF3A6NGB9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WIPF3A6NGB9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WIPF3A6NGB9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WIPF3A6NGB9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WIPF3A6NGB9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WIPF3A6NGB9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WIPF3A6NGB9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WIPF3A6NGB9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WIPF3A6NGB9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WIPF3A6NGB9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WIPF3A6NGB9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WIPF3A6NGB9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
WIPF3A6NGB9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WIPF3A6NGB9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WIPF3A6NGB9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WIPF3A6NGB9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WIPF3A6NGB9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WIPF3A6NGB9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms