Protein–RNA interactions for Protein: A5LHX3

PSMB11, Proteasome subunit beta type-11, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB11A5LHX3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB11A5LHX3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB11A5LHX3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB11A5LHX3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB11A5LHX3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB11A5LHX3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB11A5LHX3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB11A5LHX3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB11A5LHX3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB11A5LHX3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB11A5LHX3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB11A5LHX3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB11A5LHX3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB11A5LHX3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB11A5LHX3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB11A5LHX3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB11A5LHX3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB11A5LHX3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB11A5LHX3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB11A5LHX3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB11A5LHX3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB11A5LHX3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB11A5LHX3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB11A5LHX3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB11A5LHX3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB11A5LHX3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMB11A5LHX3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB11A5LHX3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB11A5LHX3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB11A5LHX3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB11A5LHX3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB11A5LHX3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB11A5LHX3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB11A5LHX3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB11A5LHX3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB11A5LHX3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB11A5LHX3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB11A5LHX3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB11A5LHX3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMB11A5LHX3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB11A5LHX3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB11A5LHX3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB11A5LHX3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB11A5LHX3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB11A5LHX3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB11A5LHX3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB11A5LHX3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB11A5LHX3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB11A5LHX3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB11A5LHX3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB11A5LHX3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB11A5LHX3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB11A5LHX3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB11A5LHX3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB11A5LHX3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB11A5LHX3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB11A5LHX3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB11A5LHX3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB11A5LHX3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB11A5LHX3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB11A5LHX3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB11A5LHX3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB11A5LHX3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB11A5LHX3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB11A5LHX3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB11A5LHX3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB11A5LHX3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB11A5LHX3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB11A5LHX3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB11A5LHX3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB11A5LHX3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB11A5LHX3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB11A5LHX3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB11A5LHX3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB11A5LHX3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB11A5LHX3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB11A5LHX3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB11A5LHX3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB11A5LHX3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB11A5LHX3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB11A5LHX3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB11A5LHX3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB11A5LHX3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB11A5LHX3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB11A5LHX3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB11A5LHX3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB11A5LHX3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMB11A5LHX3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMB11A5LHX3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB11A5LHX3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB11A5LHX3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB11A5LHX3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB11A5LHX3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB11A5LHX3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB11A5LHX3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB11A5LHX3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB11A5LHX3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB11A5LHX3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB11A5LHX3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB11A5LHX3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms