Protein–RNA interactions for Protein: A4IF30

SLC35F4, Solute carrier family 35 member F4, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F4A4IF30 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC35F4A4IF30 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC35F4A4IF30 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC35F4A4IF30 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC35F4A4IF30 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC35F4A4IF30 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC35F4A4IF30 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC35F4A4IF30 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC35F4A4IF30 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC35F4A4IF30 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC35F4A4IF30 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC35F4A4IF30 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC35F4A4IF30 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC35F4A4IF30 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC35F4A4IF30 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC35F4A4IF30 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC35F4A4IF30 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC35F4A4IF30 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC35F4A4IF30 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC35F4A4IF30 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC35F4A4IF30 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC35F4A4IF30 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC35F4A4IF30 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC35F4A4IF30 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC35F4A4IF30 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC35F4A4IF30 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC35F4A4IF30 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC35F4A4IF30 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC35F4A4IF30 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC35F4A4IF30 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35F4A4IF30 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35F4A4IF30 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35F4A4IF30 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35F4A4IF30 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC35F4A4IF30 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC35F4A4IF30 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC35F4A4IF30 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC35F4A4IF30 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC35F4A4IF30 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC35F4A4IF30 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC35F4A4IF30 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC35F4A4IF30 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC35F4A4IF30 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC35F4A4IF30 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC35F4A4IF30 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC35F4A4IF30 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC35F4A4IF30 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC35F4A4IF30 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC35F4A4IF30 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC35F4A4IF30 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC35F4A4IF30 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC35F4A4IF30 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC35F4A4IF30 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC35F4A4IF30 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC35F4A4IF30 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC35F4A4IF30 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC35F4A4IF30 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35F4A4IF30 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC35F4A4IF30 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC35F4A4IF30 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC35F4A4IF30 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC35F4A4IF30 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC35F4A4IF30 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC35F4A4IF30 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35F4A4IF30 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35F4A4IF30 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35F4A4IF30 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC35F4A4IF30 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC35F4A4IF30 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC35F4A4IF30 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC35F4A4IF30 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC35F4A4IF30 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC35F4A4IF30 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC35F4A4IF30 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC35F4A4IF30 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC35F4A4IF30 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC35F4A4IF30 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC35F4A4IF30 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC35F4A4IF30 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC35F4A4IF30 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC35F4A4IF30 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC35F4A4IF30 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC35F4A4IF30 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC35F4A4IF30 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC35F4A4IF30 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC35F4A4IF30 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC35F4A4IF30 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC35F4A4IF30 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC35F4A4IF30 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC35F4A4IF30 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35F4A4IF30 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35F4A4IF30 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35F4A4IF30 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35F4A4IF30 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC35F4A4IF30 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC35F4A4IF30 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC35F4A4IF30 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35F4A4IF30 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35F4A4IF30 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35F4A4IF30 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms